38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1318 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  57.5 
 
 		 411 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  40.94 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  27.91 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1551  phage replication protein O, putative  29.85 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000336071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2260  hypothetical protein  36.22 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4130  phage replication protein O  27.34 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.763522  normal  0.367122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  26.52 
 
 		 344 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  35.48 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  35.48 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  47.37 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  35.48 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  35.48 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  27.27 
 
 		 333 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  34.75 
 
 		 326 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  45.61 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  44.64 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  44.64 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  44.64 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  44.64 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  51.02 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  51.02 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  51.02 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  33.61 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3957  hypothetical protein  71.43 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  29.58 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  41.38 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  39.68 
 
 		 455 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1161  hypothetical protein  37.31 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000610195  hitchhiker  1.74313e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1424  hypothetical protein  37.31 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000647659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1756  hypothetical protein  37.31 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000208763  hitchhiker  0.000309878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1833  hypothetical protein  37.31 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000938078  decreased coverage  0.0000000000000142087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3166  hypothetical protein  37.31 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168095  hitchhiker  1.83761e-16 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  25.23 
 
 		 339 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  29.5 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  29.5 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>