More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1227 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  91.59 
 
 		 212 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  91.12 
 
 		 214 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  91.2 
 
 		 214 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  77.1 
 
 		 226 aa  317  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  72.04 
 
 		 242 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  67.91 
 
 		 242 aa  278  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  59.52 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  56.65 
 
 		 205 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  53.99 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  55.96 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  48.03 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  48.03 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.67 
 
 		 173 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  51.06 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 177 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  51.2 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  46.15 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  45.89 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  50.37 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  50 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 174 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  38.66 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 179 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  45.39 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  46.04 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  44 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  44 
 
 		 177 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  48.06 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  48.78 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  48.78 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  48.78 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  49.59 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  43.75 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  47.97 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  47.97 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  47.97 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  47.97 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  47.97 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  47.97 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  47.97 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  47.97 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  42.11 
 
 		 191 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  42.47 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  42.47 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 255 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  44.35 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  42.47 
 
 		 172 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  47.15 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  44.62 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  41.5 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  40.32 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  33.71 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  41.38 
 
 		 170 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  47.15 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  49.12 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  36.27 
 
 		 363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  39.84 
 
 		 133 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  34.52 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  39.87 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  40.82 
 
 		 194 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  34.5 
 
 		 364 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  41.8 
 
 		 170 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 363 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  42.4 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  41.67 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  44.2 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  38.52 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  44.72 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  38.52 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  34.93 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  33.99 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  38.52 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  36 
 
 		 283 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  45 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  36 
 
 		 283 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  34.36 
 
 		 369 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>