More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1214 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  88.57 
 
 
458 aa  823  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  88.72 
 
 
457 aa  816  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
463 aa  931  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  88.02 
 
 
463 aa  823  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  67.95 
 
 
472 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  55.41 
 
 
445 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  56.98 
 
 
446 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  54.48 
 
 
443 aa  439  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  52.82 
 
 
446 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  51.47 
 
 
446 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.15 
 
 
445 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.9 
 
 
448 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  51.01 
 
 
442 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.79 
 
 
442 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 
448 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
471 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
449 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
448 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
444 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  28.05 
 
 
446 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  34.41 
 
 
452 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  28.07 
 
 
471 aa  163  8e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
459 aa  160  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
465 aa  159  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
457 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  36.99 
 
 
381 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  29.07 
 
 
449 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  31.66 
 
 
449 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  29.07 
 
 
449 aa  150  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  27.02 
 
 
455 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
449 aa  149  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
442 aa  148  2e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
449 aa  147  4e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  26.8 
 
 
455 aa  147  4e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
446 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  5.01512e-05  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
446 aa  146  7e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
389 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  33.22 
 
 
449 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  2.6524e-09 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  27.56 
 
 
457 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
449 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
446 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  1.82562e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
458 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
469 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  32.98 
 
 
458 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  1.37847e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  32.97 
 
 
449 aa  142  1e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
449 aa  142  1e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
466 aa  142  2e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  27.9 
 
 
461 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
429 aa  140  4e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  34.05 
 
 
429 aa  140  4e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
446 aa  140  5e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  3.35712e-10 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  29.6 
 
 
450 aa  139  8e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  37.41 
 
 
446 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
454 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
458 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
459 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.34801e-06  unclonable  3.36351e-08 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  33.01 
 
 
453 aa  138  3e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
467 aa  137  3e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  33.11 
 
 
458 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
440 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
455 aa  136  7e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  35.24 
 
 
453 aa  135  1e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
455 aa  135  1e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  29.27 
 
 
472 aa  135  1e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
435 aa  135  2e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  9.971e-12 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  28.21 
 
 
456 aa  135  2e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
421 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  33.33 
 
 
465 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  32.46 
 
 
445 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.85 
 
 
471 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  33.8 
 
 
480 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  26.59 
 
 
457 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
454 aa  133  7e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  27.29 
 
 
468 aa  132  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
419 aa  131  2e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
420 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.57 
 
 
1162 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
446 aa  130  4e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  34.65 
 
 
363 aa  129  7e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  38.27 
 
 
445 aa  129  1e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
445 aa  129  1e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
723 aa  128  2e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  33.78 
 
 
416 aa  128  2e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
455 aa  128  2e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  4.04182e-09 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
379 aa  127  4e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
439 aa  127  4e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
379 aa  127  4e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
453 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
443 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
471 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  32.64 
 
 
423 aa  126  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  28.17 
 
 
518 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
379 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
466 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
466 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
466 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
466 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  34.97 
 
 
469 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
466 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  32.45 
 
 
508 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>