More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1162 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  52.07 
 
 		 968 aa  953    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  52.18 
 
 		 968 aa  956    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  52.18 
 
 		 968 aa  956    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  49.84 
 
 		 968 aa  920    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  96.2 
 
 		 948 aa  1857    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  51.8 
 
 		 944 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  49.58 
 
 		 949 aa  848    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  52.91 
 
 		 967 aa  949    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  49.03 
 
 		 975 aa  907    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  50.26 
 
 		 968 aa  925    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  43.75 
 
 		 960 aa  667    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  87.45 
 
 		 948 aa  1717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  43.5 
 
 		 958 aa  828    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  43.19 
 
 		 958 aa  822    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  87.24 
 
 		 948 aa  1714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  41.59 
 
 		 982 aa  707    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 		 948 aa  1922    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  52.28 
 
 		 968 aa  944    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  97.05 
 
 		 948 aa  1873    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  51.29 
 
 		 968 aa  937    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  83.72 
 
 		 948 aa  1619    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  52.18 
 
 		 968 aa  955    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  49.38 
 
 		 968 aa  910    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  46.65 
 
 		 947 aa  811    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  49.48 
 
 		 968 aa  906    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  49.95 
 
 		 968 aa  922    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  88.82 
 
 		 948 aa  1743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  96.1 
 
 		 948 aa  1855    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  50 
 
 		 969 aa  908    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  49.95 
 
 		 968 aa  922    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  52.18 
 
 		 968 aa  955    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  52.28 
 
 		 968 aa  944    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  49.69 
 
 		 968 aa  910    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  50.26 
 
 		 969 aa  917    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  46.83 
 
 		 980 aa  771    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  52.28 
 
 		 968 aa  945    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  40.63 
 
 		 982 aa  666    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  50.16 
 
 		 969 aa  900    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  41.8 
 
 		 1028 aa  710    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  49.84 
 
 		 968 aa  922    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  51.09 
 
 		 968 aa  925    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  46.08 
 
 		 943 aa  814    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  49.59 
 
 		 966 aa  865    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  51.66 
 
 		 967 aa  935    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  83.98 
 
 		 949 aa  1632    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  50.16 
 
 		 968 aa  927    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  50.16 
 
 		 968 aa  927    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  48.76 
 
 		 968 aa  912    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  51.09 
 
 		 968 aa  925    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  84.14 
 
 		 950 aa  1633    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  52.65 
 
 		 967 aa  949    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  52.81 
 
 		 967 aa  946    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  52.28 
 
 		 968 aa  944    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  50.26 
 
 		 968 aa  929    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  49.02 
 
 		 968 aa  907    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  49.95 
 
 		 969 aa  915    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  85.71 
 
 		 947 aa  1665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  51.76 
 
 		 968 aa  935    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  52.18 
 
 		 968 aa  956    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  49.95 
 
 		 968 aa  921    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  52.18 
 
 		 968 aa  956    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  49.84 
 
 		 967 aa  893    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  51.96 
 
 		 919 aa  897    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  49.22 
 
 		 970 aa  912    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  52.18 
 
 		 968 aa  955    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  48.76 
 
 		 968 aa  900    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  50.99 
 
 		 968 aa  924    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  49.74 
 
 		 953 aa  852    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  40.04 
 
 		 942 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  36.2 
 
 		 874 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  33.33 
 
 		 898 aa  187  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  33.15 
 
 		 898 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  32.45 
 
 		 905 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  33.51 
 
 		 892 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 941 aa  161  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 941 aa  161  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.8 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 933 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1144 aa  147  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.97 
 
 		 835 aa  147  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.76 
 
 		 1167 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  26.98 
 
 		 560 aa  145  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  26.98 
 
 		 560 aa  145  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  26.98 
 
 		 560 aa  145  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  26.98 
 
 		 560 aa  145  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  26.98 
 
 		 560 aa  145  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  26.98 
 
 		 560 aa  145  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  28.31 
 
 		 578 aa  144  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  26.98 
 
 		 560 aa  144  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  26.68 
 
 		 560 aa  144  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  26.98 
 
 		 560 aa  144  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 560 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.07 
 
 		 969 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  26.4 
 
 		 966 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.96 
 
 		 1167 aa  141  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.14 
 
 		 962 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.63 
 
 		 1145 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.35 
 
 		 1167 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  25.17 
 
 		 801 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.4 
 
 		 1170 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>