More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1143 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  77.82 
 
 		 239 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  77.82 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  77.41 
 
 		 264 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  68.05 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  62.55 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  36.86 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  36.86 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  42.92 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  42.26 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  42.21 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  41.77 
 
 		 445 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.5 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.29 
 
 		 429 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  40.62 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.49 
 
 		 440 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  41.56 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  39.87 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.68 
 
 		 607 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40.24 
 
 		 449 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 417 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  45.08 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.35 
 
 		 420 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.14 
 
 		 344 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.44 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.42 
 
 		 376 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.77 
 
 		 344 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.97 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.25 
 
 		 427 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.01 
 
 		 447 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.24 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.24 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.96 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.14 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.14 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.14 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40.51 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  41.14 
 
 		 351 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.97 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.26 
 
 		 445 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  37.43 
 
 		 402 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.74 
 
 		 478 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.51 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.86 
 
 		 330 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  32.73 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 388 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  40.16 
 
 		 355 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  34.84 
 
 		 372 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 369 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  33.55 
 
 		 369 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 		 373 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 		 369 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  34.03 
 
 		 266 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  35.93 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 376 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  37.13 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  41.32 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  33.55 
 
 		 370 aa  99.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  46.15 
 
 		 415 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  46.96 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  46.34 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  34.93 
 
 		 348 aa  99  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 225 aa  99  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 212 aa  99  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.57 
 
 		 320 aa  98.6  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.08 
 
 		 623 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  43.52 
 
 		 334 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.12 
 
 		 1755 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  50.51 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.54 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 401 aa  95.5  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  47.62 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 365 aa  95.5  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.42 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  33.76 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>