More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1119 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  90.38 
 
 		 207 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  90.38 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  90.38 
 
 		 207 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  84.54 
 
 		 208 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  84.54 
 
 		 208 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  82.61 
 
 		 208 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  62.32 
 
 		 212 aa  277  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 208 aa  274  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 206 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  59.13 
 
 		 207 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  59.13 
 
 		 205 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 205 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  57 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  57 
 
 		 207 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  58.45 
 
 		 209 aa  240  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  58.94 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.1 
 
 		 208 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  59.42 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  59.42 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  43.41 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1863  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  43.41 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3412  LuxR family DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  38.94 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  38.94 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  38.94 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  38.94 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  38.94 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  38.54 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  34.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  34.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  34.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  34.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  34.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  34.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  34.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  33.99 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  34.63 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  34.63 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  34.63 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  34.15 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  34.15 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  34.15 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  35.92 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  34.02 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  35.92 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  37.32 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  37.32 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  35.44 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1808  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000516369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.55 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  34.93 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  35.07 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  35.07 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  36.15 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  36.06 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  36.06 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  36.06 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  36.06 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>