275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1111 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  100 
 
 
157 aa  313  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  95.54 
 
 
157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  95.54 
 
 
157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  94.27 
 
 
157 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  89.81 
 
 
158 aa  286  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  87.18 
 
 
156 aa  274  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  86.54 
 
 
156 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  86.54 
 
 
156 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  81.41 
 
 
156 aa  258  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  74.52 
 
 
158 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  74.52 
 
 
158 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  72.08 
 
 
154 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  71.43 
 
 
157 aa  228  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  70.7 
 
 
158 aa  227  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  70.7 
 
 
172 aa  226  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  68.39 
 
 
158 aa  224  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  70.97 
 
 
159 aa  221  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  70.13 
 
 
154 aa  220  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  68.83 
 
 
158 aa  220  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  68.15 
 
 
159 aa  214  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  65.61 
 
 
157 aa  213  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  66.24 
 
 
159 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  68.83 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  66.24 
 
 
159 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  68.83 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  69.03 
 
 
159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  67.1 
 
 
158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  66.03 
 
 
158 aa  208  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  64.97 
 
 
160 aa  208  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  66.45 
 
 
159 aa  207  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  64.29 
 
 
156 aa  207  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  63.69 
 
 
157 aa  206  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  64.52 
 
 
158 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  63.06 
 
 
157 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  65.16 
 
 
224 aa  205  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  65.58 
 
 
158 aa  205  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  66.88 
 
 
158 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  63.69 
 
 
157 aa  205  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  63.87 
 
 
158 aa  205  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  63.06 
 
 
157 aa  205  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  64.94 
 
 
158 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  64.94 
 
 
158 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  64.94 
 
 
158 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  64.94 
 
 
158 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  64.52 
 
 
180 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  65.58 
 
 
158 aa  204  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  64.94 
 
 
158 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  65.58 
 
 
158 aa  204  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  64.52 
 
 
158 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  64.52 
 
 
158 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  64.52 
 
 
158 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  64.52 
 
 
158 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  64.52 
 
 
158 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  64.94 
 
 
158 aa  204  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  64.52 
 
 
158 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  63.06 
 
 
157 aa  203  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  63.06 
 
 
157 aa  203  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  64.94 
 
 
159 aa  203  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  63.87 
 
 
158 aa  203  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  64.94 
 
 
158 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  63.23 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  63.64 
 
 
154 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  65.16 
 
 
158 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  69.68 
 
 
157 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  63.23 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  63.87 
 
 
159 aa  201  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  63.23 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  63.87 
 
 
159 aa  201  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  63.23 
 
 
158 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  63.87 
 
 
158 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  63.23 
 
 
158 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  64.1 
 
 
159 aa  201  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  61.54 
 
 
156 aa  200  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  61.78 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  61.78 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  61.78 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  61.78 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  61.78 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  62.82 
 
 
158 aa  197  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  60.9 
 
 
159 aa  196  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  60.9 
 
 
158 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  60.9 
 
 
158 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  63.87 
 
 
158 aa  196  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  62.99 
 
 
154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  58.97 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  59.74 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  61.15 
 
 
158 aa  192  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2834  bacterioferritin  61.69 
 
 
154 aa  191  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517561  normal  0.0403197 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  59.09 
 
 
154 aa  187  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  58.33 
 
 
158 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  59.09 
 
 
154 aa  186  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  57.05 
 
 
158 aa  184  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  58.49 
 
 
159 aa  184  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2530  bacterioferritin subunit 2  63.64 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  0.794719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  58.33 
 
 
159 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1168  bacterioferritin, subunit 2  58.06 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.316626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  59.86 
 
 
162 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2230  bacterioferritin  55.19 
 
 
156 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  57.33 
 
 
159 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  53.9 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>