More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1066 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  65.15 
 
 		 540 aa  707    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  65.15 
 
 		 540 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  64.72 
 
 		 537 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  64.77 
 
 		 532 aa  724    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  95.5 
 
 		 534 aa  1060    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  64.92 
 
 		 533 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  63.99 
 
 		 533 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  64.35 
 
 		 539 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  64.52 
 
 		 533 aa  707    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  65.15 
 
 		 540 aa  709    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  62.29 
 
 		 538 aa  698    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  65.92 
 
 		 532 aa  740    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  64.49 
 
 		 537 aa  731    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  89.49 
 
 		 538 aa  995    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  64.64 
 
 		 533 aa  704    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  87.05 
 
 		 538 aa  969    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1097  L-aspartate oxidase  64.23 
 
 		 531 aa  717    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565133  normal  0.0527143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  64.54 
 
 		 535 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  64.27 
 
 		 528 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  59.43 
 
 		 541 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  89.68 
 
 		 538 aa  996    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  65.15 
 
 		 540 aa  707    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  62.83 
 
 		 525 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  64.35 
 
 		 540 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  65.09 
 
 		 536 aa  733    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  64.73 
 
 		 539 aa  722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  64.39 
 
 		 528 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  62.78 
 
 		 541 aa  688    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03543  L-aspartate oxidase  63.91 
 
 		 559 aa  705    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  62.19 
 
 		 563 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  64.84 
 
 		 533 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  67.05 
 
 		 539 aa  748    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  89.49 
 
 		 538 aa  997    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  65.09 
 
 		 540 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  64.08 
 
 		 528 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  64.84 
 
 		 532 aa  710    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  87.43 
 
 		 543 aa  974    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  60.45 
 
 		 552 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 534 aa  1102    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  64.72 
 
 		 537 aa  731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  64.92 
 
 		 545 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  57.39 
 
 		 533 aa  641    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  64.72 
 
 		 537 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  59.62 
 
 		 530 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  65.91 
 
 		 550 aa  743    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  64.53 
 
 		 537 aa  730    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  63.13 
 
 		 534 aa  708    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  64.54 
 
 		 570 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  64.53 
 
 		 533 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  65.09 
 
 		 540 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  95.5 
 
 		 534 aa  1059    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  65.42 
 
 		 537 aa  735    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  67.97 
 
 		 542 aa  752    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  60.71 
 
 		 536 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  70.11 
 
 		 555 aa  772    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  64.53 
 
 		 537 aa  724    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  65.09 
 
 		 538 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  65.09 
 
 		 538 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  61.41 
 
 		 541 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  63.21 
 
 		 529 aa  665    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  65.22 
 
 		 532 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  66.36 
 
 		 537 aa  743    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  64.72 
 
 		 536 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  94.75 
 
 		 535 aa  1058    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  64.92 
 
 		 533 aa  719    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  65.03 
 
 		 535 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  62.08 
 
 		 529 aa  649    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  66.04 
 
 		 545 aa  737    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  64.54 
 
 		 570 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2315  L-aspartate oxidase  58.47 
 
 		 528 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  64.27 
 
 		 528 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  65.15 
 
 		 540 aa  707    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  65.28 
 
 		 536 aa  735    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  62.79 
 
 		 534 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  64.54 
 
 		 570 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  64.54 
 
 		 570 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  64.35 
 
 		 540 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  63.96 
 
 		 537 aa  728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  64.15 
 
 		 537 aa  730    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  67.38 
 
 		 544 aa  707    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  64.93 
 
 		 538 aa  735    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  65.15 
 
 		 540 aa  707    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  64.65 
 
 		 528 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  87.05 
 
 		 538 aa  969    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  64.27 
 
 		 528 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  65.97 
 
 		 532 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  58.59 
 
 		 539 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  64.15 
 
 		 537 aa  727    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  65.09 
 
 		 530 aa  705    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  61.22 
 
 		 561 aa  663    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  64.65 
 
 		 528 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  61.16 
 
 		 531 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  65.23 
 
 		 535 aa  737    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  60.04 
 
 		 552 aa  664    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  64.92 
 
 		 543 aa  721    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  64.54 
 
 		 570 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  73.36 
 
 		 542 aa  833    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  64.27 
 
 		 528 aa  700    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  63.65 
 
 		 529 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  60.67 
 
 		 525 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>