26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0752 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  88.21 
 
 		 266 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  87.83 
 
 		 266 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  87.45 
 
 		 267 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  60.84 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  61.15 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  62.26 
 
 		 256 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  62.17 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  60.22 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  55.82 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  82.57 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  47.47 
 
 		 198 aa  85.5  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  41.5 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  46.48 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  44.57 
 
 		 137 aa  62  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  34.65 
 
 		 615 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  36.08 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  41.86 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  37.11 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  41.86 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  36.08 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  36.78 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1621  hypothetical protein  38.78 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215267  unclonable  0.000000000374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3094  hypothetical protein  37.89 
 
 		 177 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.779162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0533  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>