22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0686 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  100 
 
 		 326 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  83.95 
 
 		 326 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  69.44 
 
 		 326 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  64.81 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  35.22 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  34.12 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  30.94 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  28.97 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  22.96 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  32.53 
 
 		 288 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  31.1 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  26.62 
 
 		 487 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  41.79 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  28.2 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  24.23 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  32.41 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  34.72 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  32.41 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  31.58 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>