57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0603 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  86.14 
 
 
642 aa  983    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  69.31 
 
 
575 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  67.72 
 
 
575 aa  746    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  71.72 
 
 
575 aa  827    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  100 
 
 
577 aa  1175    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  87.35 
 
 
577 aa  994    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  59.72 
 
 
579 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  86.48 
 
 
603 aa  989    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  60.82 
 
 
577 aa  661    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  60.25 
 
 
579 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1518  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  39.7 
 
 
500 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00370729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2722  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  39.22 
 
 
500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  35.91 
 
 
468 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1718  hypothetical protein  39.57 
 
 
466 aa  154  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255426  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  35.85 
 
 
500 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1997  hypothetical protein  39.22 
 
 
493 aa  153  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0516  hypothetical protein  41.71 
 
 
454 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  36.68 
 
 
501 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  34.89 
 
 
350 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  36.68 
 
 
501 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00845  hypothetical protein  38.67 
 
 
361 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06082  hypothetical protein  38.67 
 
 
361 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  34.71 
 
 
507 aa  144  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0943  hypothetical protein  38.7 
 
 
519 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707363  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  34.17 
 
 
350 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  34.25 
 
 
500 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  33.66 
 
 
488 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7222  hypothetical protein  36.4 
 
 
514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0191551  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  30.41 
 
 
352 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  35.42 
 
 
538 aa  113  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  35.45 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7823  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  41.26 
 
 
271 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  38.02 
 
 
226 aa  106  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  38.22 
 
 
202 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  28.73 
 
 
576 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  33.49 
 
 
312 aa  93.6  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  27.33 
 
 
662 aa  90.1  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  31.73 
 
 
315 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  33.33 
 
 
211 aa  89.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3361  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  29.69 
 
 
265 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259599  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  31.82 
 
 
167 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  28.16 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  31.32 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  32.89 
 
 
160 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  41.56 
 
 
136 aa  64.3  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  32.19 
 
 
172 aa  63.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  34.23 
 
 
248 aa  62.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  32.31 
 
 
107 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  36.14 
 
 
126 aa  54.3  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  35.35 
 
 
356 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26666  predicted protein  31.52 
 
 
325 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0751  hypothetical protein  27.64 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.914209  normal  0.0303897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 
457 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  28.57 
 
 
1319 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.47 
 
 
309 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93578  predicted protein  33.68 
 
 
686 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000533165  normal  0.01596 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  26.94 
 
 
212 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>