More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0474 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  95.11 
 
 		 184 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  92.93 
 
 		 184 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  92.93 
 
 		 184 aa  341  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  59.66 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  58.05 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  58.05 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  55.49 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  56.07 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  55.49 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  40.57 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  44.83 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  38.29 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  42.47 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  42.47 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  39.08 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  42.67 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  35.5 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  32.37 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  30.64 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  30.64 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  42.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  31.36 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  33.33 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  39.18 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  27.97 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  35.4 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  30.51 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.33 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  22.96 
 
 		 466 aa  68.6  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.23 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  26.53 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.22 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  35.66 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.41 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  32.23 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  38.04 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  28.89 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  31.75 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  34.78 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.81 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  27.2 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.33 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.15 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  31.34 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  31.93 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.97 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  27.42 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.57 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.5 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.92 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  26.05 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  34.51 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  28.57 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.09 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.25 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.92 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.09 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  32.52 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  26.67 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.09 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  31.09 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.32 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.33 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  32.59 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.25 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.92 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  27.36 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.7 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.45 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  32.52 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.25 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.5 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.91 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  28.28 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  30.69 
 
 		 168 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.25 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  30.25 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  30.25 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  30.25 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  30.61 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.34 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  30.6 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  36.27 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  32.03 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.09 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  31.2 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30.71 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.71 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  27.5 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  32.04 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  30.7 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>