More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0445 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.39 
 
 
638 aa  970    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
638 aa  1256    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  62.11 
 
 
638 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  61.16 
 
 
638 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0378  chemotaxis sensory transducer  69.44 
 
 
638 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.39 
 
 
638 aa  969    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.17 
 
 
638 aa  988    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.88 
 
 
619 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  51.9 
 
 
633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  53.97 
 
 
639 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  52.07 
 
 
629 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  51.55 
 
 
640 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.26 
 
 
640 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  53.09 
 
 
647 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  51.41 
 
 
640 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.31 
 
 
647 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.5 
 
 
639 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.26 
 
 
639 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.73 
 
 
639 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.95 
 
 
639 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.01 
 
 
640 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  49.92 
 
 
647 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
739 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.25 
 
 
647 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  49.85 
 
 
647 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
639 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.24 
 
 
647 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
647 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  43.82 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  44.41 
 
 
676 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
681 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
650 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.4 
 
 
626 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 
634 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.78 
 
 
285 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.553976  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 
654 aa  339  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  49.04 
 
 
652 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.84 
 
 
632 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 
544 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
522 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3892  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.6 
 
 
646 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.6 
 
 
646 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 
646 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 
541 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  43.49 
 
 
541 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.54 
 
 
541 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.98 
 
 
543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
541 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
541 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.97 
 
 
646 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0815522  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 
655 aa  280  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
425 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.87 
 
 
541 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 
637 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  47.73 
 
 
541 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  46.15 
 
 
546 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 
674 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 
570 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
637 aa  273  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 
540 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 
541 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 
541 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 
541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 
555 aa  271  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
541 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 
541 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
541 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.43 
 
 
646 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  45.32 
 
 
712 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  45.32 
 
 
712 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.7 
 
 
523 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  47.86 
 
 
541 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.89 
 
 
679 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  47.29 
 
 
541 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  44.66 
 
 
541 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
552 aa  259  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.4 
 
 
636 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 
713 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
638 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.94 
 
 
716 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 
542 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  45.05 
 
 
541 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.23 
 
 
540 aa  257  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
546 aa  256  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 
542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.22 
 
 
634 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.92 
 
 
714 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.39 
 
 
541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 
541 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
634 aa  253  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 
541 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
624 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 
541 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
546 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 
541 aa  252  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>