297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0361 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0361  thiazole synthase  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148225  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5104  thiazole synthase  94.44 
 
 
270 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433901  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5154  thiazole synthase  94.44 
 
 
270 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.65179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4977  thiazole synthase  94.44 
 
 
270 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0434  thiazole biosynthesis protein ThiG  92.8 
 
 
264 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4740  thiazole synthase  92.8 
 
 
264 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5330  thiazole synthase  92.42 
 
 
264 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4167  thiazole synthase  89.77 
 
 
264 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.64186  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0480  thiazole synthase  89.92 
 
 
265 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02980  thiazole synthase  89.77 
 
 
264 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04980  thiazole synthase  89.53 
 
 
265 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0070  thiazole synthase  74.51 
 
 
264 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.496923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3236  thiazole biosynthesis family protein  73.18 
 
 
264 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3190  thiazole biosynthesis family protein  73.26 
 
 
264 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0034  thiazole synthase  73.83 
 
 
262 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2126  thiazole synthase  72.48 
 
 
262 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3146  thiazole synthase  72.69 
 
 
266 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711533  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  72.16 
 
 
326 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0224  thiazole synthase  71.43 
 
 
274 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  70.59 
 
 
347 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2464  thiazole biosynthesis family protein  70.54 
 
 
268 aa  384  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2637  thiazole synthase  72.55 
 
 
259 aa  384  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0248  thiazole synthase  71.83 
 
 
274 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3503  thiazole biosynthesis family protein  73.33 
 
 
269 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4064  thiazole synthase  71.32 
 
 
261 aa  381  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01841  thiazole synthase  71.03 
 
 
264 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1824  thiazole biosynthesis family protein  72.05 
 
 
263 aa  374  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1983  thiazole synthase  66.92 
 
 
275 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2061  thiazole synthase  66.92 
 
 
275 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.864021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1839  thiazole synthase  66.92 
 
 
282 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2399  thiazole synthase  69.96 
 
 
262 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3861  thiazole synthase  67.84 
 
 
260 aa  360  9e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0385604  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0643  thiamin biosynthesis protein ThiG  65.38 
 
 
260 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.924132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0793  thiazole biosynthesis family protein  65.38 
 
 
260 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.372773  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1269  thiazole synthase  63.88 
 
 
267 aa  348  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0262061  hitchhiker  0.00290038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  67.86 
 
 
326 aa  347  9e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  66.67 
 
 
329 aa  346  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  59.62 
 
 
267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3288  thiazole synthase  65.5 
 
 
270 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  63.32 
 
 
260 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  63.71 
 
 
260 aa  322  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  63.5 
 
 
260 aa  318  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  62.4 
 
 
258 aa  317  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  61.78 
 
 
260 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  61 
 
 
260 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  62.2 
 
 
331 aa  311  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2568  thiazole synthase  62.02 
 
 
268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  61.63 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  55.73 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  59.53 
 
 
374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  60.24 
 
 
256 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  61.42 
 
 
257 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  57.85 
 
 
272 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  59.45 
 
 
257 aa  291  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  59.45 
 
 
257 aa  291  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  59.45 
 
 
257 aa  291  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0483  thiazole synthase  56.75 
 
 
256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.525067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0217  thiazole synthase  56.68 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2164  thiazole biosynthesis family protein  55.82 
 
 
263 aa  278  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  55.51 
 
 
272 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  53.99 
 
 
277 aa  274  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  54.9 
 
 
252 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  53.82 
 
 
652 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  53.1 
 
 
272 aa  268  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  52.38 
 
 
296 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  53.57 
 
 
266 aa  265  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  53.33 
 
 
291 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  52.29 
 
 
279 aa  264  8.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0613  thiazole synthase  54.44 
 
 
255 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  54.22 
 
 
252 aa  261  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  53.17 
 
 
256 aa  261  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3633  thiazole biosynthesis family protein  53.79 
 
 
281 aa  259  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  52.34 
 
 
262 aa  258  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  55.2 
 
 
262 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1417  thiazole synthase  54.44 
 
 
255 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  52.36 
 
 
281 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  53.49 
 
 
666 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  53.49 
 
 
666 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34630  thiazole-phosphate synthase  51.81 
 
 
261 aa  254  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.087197  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  49.81 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0619  thiazole synthase  52.61 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  51.2 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  55.04 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  52.16 
 
 
263 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  51.98 
 
 
264 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  51.38 
 
 
259 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  50.99 
 
 
254 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  52.29 
 
 
684 aa  249  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  51.18 
 
 
264 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  51.38 
 
 
256 aa  248  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  52.51 
 
 
286 aa  248  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  51.59 
 
 
264 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1338  thiazole biosynthesis family protein  55.16 
 
 
264 aa  245  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.98593  hitchhiker  0.000526454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  48.86 
 
 
268 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0789  thiazole synthase  50.6 
 
 
256 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4542  thiazole synthase  50.6 
 
 
256 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0642  thiazole synthase  50.2 
 
 
258 aa  245  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  49.81 
 
 
269 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0802  thiazole synthase  50.2 
 
 
256 aa  244  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0886  thiazole synthase  50.2 
 
 
256 aa  244  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000535292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>