More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0175 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  100 
 
 
249 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  93.98 
 
 
255 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  91.97 
 
 
255 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  91.97 
 
 
255 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  73.44 
 
 
249 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  72.95 
 
 
254 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  59.76 
 
 
250 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  60.83 
 
 
250 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  64.02 
 
 
253 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  63.01 
 
 
250 aa  287  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  60 
 
 
262 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  56.25 
 
 
257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  56.25 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  60.17 
 
 
261 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  57.96 
 
 
253 aa  278  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  57.5 
 
 
253 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  54.4 
 
 
254 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  58.26 
 
 
274 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  57.5 
 
 
253 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  57.08 
 
 
253 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  58.94 
 
 
254 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  58.75 
 
 
261 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  56.67 
 
 
253 aa  275  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  59.75 
 
 
261 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  59.75 
 
 
261 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  53.06 
 
 
254 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  55 
 
 
257 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  54.98 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  56.5 
 
 
253 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  56.5 
 
 
253 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  56.5 
 
 
253 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  58.05 
 
 
279 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  56.1 
 
 
253 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  53.6 
 
 
253 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  56.28 
 
 
268 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  54.58 
 
 
264 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  54.58 
 
 
264 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  52.19 
 
 
253 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  52.21 
 
 
253 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  55 
 
 
313 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  56.15 
 
 
279 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  56.15 
 
 
279 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  56.15 
 
 
279 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  56.15 
 
 
268 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  55.74 
 
 
268 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  55.33 
 
 
268 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  57.76 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  53.91 
 
 
256 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  52.84 
 
 
247 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  56.47 
 
 
349 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  56.47 
 
 
264 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  56.47 
 
 
263 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  56.47 
 
 
264 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  56.47 
 
 
263 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  56.47 
 
 
264 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  56.47 
 
 
264 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  51.05 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  51.67 
 
 
266 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  51.67 
 
 
266 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  51.25 
 
 
266 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  45.88 
 
 
297 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  51.68 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  43.98 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  47.54 
 
 
264 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  47.54 
 
 
255 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  47.74 
 
 
253 aa  204  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  46.75 
 
 
254 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  46.75 
 
 
254 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.75 
 
 
254 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.75 
 
 
254 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.75 
 
 
250 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  46.34 
 
 
254 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  47.79 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.34 
 
 
254 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  45.31 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  43.6 
 
 
253 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  45.71 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  44.81 
 
 
259 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  49.32 
 
 
256 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  45.71 
 
 
253 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  41.91 
 
 
267 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  43.03 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  43.03 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  40.59 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  43.13 
 
 
269 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  42.57 
 
 
288 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  42.65 
 
 
269 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  43.13 
 
 
269 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  44.95 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  42.37 
 
 
281 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  42.62 
 
 
259 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  42.68 
 
 
259 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  42.62 
 
 
263 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  38.78 
 
 
269 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  44.21 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  41.39 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  44.25 
 
 
276 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4584  putative gamma-glutamyl hydrolase family protein  42.34 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3803  peptidase C26  44.44 
 
 
267 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  39.52 
 
 
273 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>