More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0134 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  668    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  90.3 
 
 		 330 aa  590  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  90 
 
 		 330 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  90 
 
 		 356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  75.38 
 
 		 332 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  54.38 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  35.06 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  35.06 
 
 		 339 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  34.32 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 366 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 425 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 352 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  35.17 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  30.15 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  31.38 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 370 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  27.93 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  30.75 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  27.24 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0132  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  30.63 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.968788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3765  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 357 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  26.27 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  34.03 
 
 		 353 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>