More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0118 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  100 
 
 		 239 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  95.82 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  95.82 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  95.82 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  79.46 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  79 
 
 		 246 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  78.57 
 
 		 242 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  78.44 
 
 		 221 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  78.12 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  76.34 
 
 		 242 aa  363  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  68.62 
 
 		 248 aa  342  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  57.48 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  57.48 
 
 		 219 aa  254  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  55.14 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  52.49 
 
 		 219 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  54.07 
 
 		 211 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  52.94 
 
 		 218 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  53.27 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  53.67 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  53.67 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  53.67 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  53.67 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  53.43 
 
 		 211 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  53.67 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  55.39 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  53.67 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  54.9 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  53.74 
 
 		 219 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  53.21 
 
 		 219 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  53.21 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  54.41 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  53.43 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  55.78 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  54.41 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  54.41 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  51.47 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  51.64 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  51.47 
 
 		 211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  54.29 
 
 		 234 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  51.4 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  52.13 
 
 		 258 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  49.54 
 
 		 219 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  50.74 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  51.87 
 
 		 219 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  51.35 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  51.89 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  50.7 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  50.25 
 
 		 211 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  51.4 
 
 		 219 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  51.42 
 
 		 219 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  52.5 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  50.23 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  50.23 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  50.23 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  50.23 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  50.73 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  45.81 
 
 		 217 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  51.14 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  51.72 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  48.84 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  45.32 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  48.51 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  48.02 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  48.02 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  51.5 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  45.97 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  54.6 
 
 		 182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  43.98 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  46.31 
 
 		 284 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  47.45 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  42.08 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  40.98 
 
 		 356 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  43.41 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  36.82 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  40.49 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  41.75 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  42.57 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  43.2 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  40.38 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  40.54 
 
 		 787 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  36 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  37.75 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  36.1 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  36.1 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  36.1 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  40.64 
 
 		 749 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  35.98 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  40.82 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  36.02 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  34.93 
 
 		 214 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  36.27 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  38.98 
 
 		 877 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  37.56 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>