20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0109 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  94.16 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  91.97 
 
 		 137 aa  266  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  91.97 
 
 		 137 aa  266  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  53.23 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  52.24 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  50.75 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  47.14 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  52.21 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  50 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  49.15 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  39.53 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  36.72 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  37.5 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  35.16 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  37.07 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>