More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0033 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  90.12 
 
 		 262 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  63.35 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  61.57 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  61.64 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  55.47 
 
 		 250 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  52.4 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  52.23 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  46.28 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  46.12 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  45.27 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  44.81 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  44.4 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  46.78 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.9 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  46.78 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  46.78 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  46.78 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  40.68 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  45.15 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  46.59 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  45.76 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 		 233 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  45.73 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  47.06 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  45.9 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  42.69 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  48.28 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  43.9 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  41.27 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.63 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  44.21 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  44.77 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  46.78 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  44.03 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  39.27 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  43.57 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  41.98 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  43.9 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  42.99 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  42.26 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  40.5 
 
 		 284 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4319  silent information regulator protein Sir2  61.94 
 
 		 131 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  41.13 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  38.71 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  40.72 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  40.54 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  41.3 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  40.87 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  40.45 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  35.27 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  38.4 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  37.39 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  39.08 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  39.19 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  36.84 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  36.44 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  36.84 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  38.72 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  37.96 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  41.1 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  40.09 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  44.67 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  38.56 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  37.76 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  40.41 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.89 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  40.42 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  36.99 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  38.43 
 
 		 231 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  39.37 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  39.41 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  41.35 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  40.34 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  39.02 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  41 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  32.39 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  39.02 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  39.02 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  39.02 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  39.02 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  40.59 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  40.59 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  40.59 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  40.59 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  40.57 
 
 		 242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  40.59 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  40.59 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  40.5 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  40.59 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  40.42 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  39.33 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  39.5 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>