27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0030 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0030  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.514853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0032  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  71.64 
 
 		 268 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  70.69 
 
 		 268 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 266 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 257 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 257 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 257 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 266 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 266 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 261 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  41.79 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 280 aa  42  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 280 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 303 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 257 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>