More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5346 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  96.47 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  96.47 
 
 		 255 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  93.98 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  72.36 
 
 		 254 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  73.44 
 
 		 249 aa  348  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  57.6 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  58.75 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  61.51 
 
 		 253 aa  284  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  56.25 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  56.25 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  60.57 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  55.14 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  56.33 
 
 		 253 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  55.14 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  54.73 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  55.42 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  56.67 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  56.91 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  55 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  51.98 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  55.51 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  55.51 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  55.51 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  51.84 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  55.1 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  54.98 
 
 		 274 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  56.78 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  55.83 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  54.18 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  56.36 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  56.36 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  52.19 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  55.51 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  52.8 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  51.81 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  52.08 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  52.08 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  53.85 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  51.67 
 
 		 313 aa  244  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  54.1 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  53.69 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  53.69 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  53.69 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  53.69 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  56.03 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  52.44 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  52.87 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  51.09 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  49.02 
 
 		 267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  54.31 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  54.31 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  54.31 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  54.31 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  54.31 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  54.31 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  54.31 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  49.79 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  49.38 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  49.38 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  44.71 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  47.13 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  41.73 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  49.38 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  45.78 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  45.31 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  46.99 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  46.99 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.99 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.99 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  46.59 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.99 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.59 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.99 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  46.67 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  42.86 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  43.78 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  42.32 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.53 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  41.94 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  41.47 
 
 		 269 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  43.27 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  41.47 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  40.17 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  41.22 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  41.04 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  41.22 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  46.61 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  42.21 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  37.45 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  40.98 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  41.42 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  43.32 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  40.32 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  39.69 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  41.15 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  41.15 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4584  putative gamma-glutamyl hydrolase family protein  41.13 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  38.71 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2762  peptidase C26  39.67 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>