More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5338 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  76.59 
 
 		 488 aa  742    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  98.28 
 
 		 466 aa  936    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  98.06 
 
 		 463 aa  929    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  77.36 
 
 		 863 aa  735    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  79.18 
 
 		 465 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  79.83 
 
 		 465 aa  772    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  81.8 
 
 		 465 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  77.8 
 
 		 868 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  100 
 
 		 466 aa  951    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  77.58 
 
 		 854 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  95.28 
 
 		 465 aa  905    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  60.43 
 
 		 881 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  58.39 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  59.29 
 
 		 468 aa  569  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  59.57 
 
 		 467 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  58.55 
 
 		 458 aa  548  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  57.58 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  56.46 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  55.87 
 
 		 462 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  56.02 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  53.7 
 
 		 471 aa  527  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  56.41 
 
 		 782 aa  528  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  53.7 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  53.81 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  55.17 
 
 		 464 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  54.95 
 
 		 457 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  54.66 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  55.75 
 
 		 485 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  53.48 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  56.4 
 
 		 464 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  56.18 
 
 		 961 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  56.18 
 
 		 472 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  56.18 
 
 		 472 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  54.23 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  56.18 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  53.83 
 
 		 461 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  53.04 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  56.18 
 
 		 472 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  56.18 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  55.97 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  53.81 
 
 		 469 aa  504  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  55.53 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  55.17 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  55.17 
 
 		 487 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  55.17 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  52.3 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  55.31 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  54.07 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  55.53 
 
 		 464 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  55.68 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  55.8 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  54.86 
 
 		 782 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  51.45 
 
 		 830 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  53.94 
 
 		 465 aa  495  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  56.26 
 
 		 460 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  55.8 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  54.63 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  54.73 
 
 		 462 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  50.33 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  50.64 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  54.67 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  54.7 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  50.33 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  55.04 
 
 		 460 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  53.22 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  51.62 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  47.36 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  47.58 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  47.14 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  45.91 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  48.55 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  46.36 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  45.98 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  43.31 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  43.94 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  43.71 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.16 
 
 		 847 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  45.04 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  45.07 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  45 
 
 		 495 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  47.2 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  43.61 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  43.76 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  44.62 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  43.59 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  42.63 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  43.97 
 
 		 464 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  41.52 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  42.38 
 
 		 469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  45.25 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  41.7 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  43.39 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  41.52 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  43.85 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  41.69 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  42.36 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  41.79 
 
 		 459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0306  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  39.35 
 
 		 455 aa  319  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0317157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  39.39 
 
 		 452 aa  318  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0102  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.49 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>