More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5277 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  97.8 
 
 
500 aa  1000    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  84.2 
 
 
500 aa  879    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  84.4 
 
 
526 aa  877    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
500 aa  1018    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  86.37 
 
 
500 aa  887    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  79.4 
 
 
500 aa  823    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  95 
 
 
500 aa  956    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  74.05 
 
 
501 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  75.45 
 
 
501 aa  791    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  74.05 
 
 
506 aa  777    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  98.2 
 
 
500 aa  1004    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  53.88 
 
 
508 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  48.77 
 
 
500 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  47.76 
 
 
505 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  48.03 
 
 
497 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  48.98 
 
 
499 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  47.07 
 
 
508 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  46.48 
 
 
508 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  45.23 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  45.85 
 
 
509 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  48.58 
 
 
506 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  45.21 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  46.27 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  43.09 
 
 
512 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  43.43 
 
 
506 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  42.77 
 
 
505 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2123  Ppx/GppA phosphatase  45.23 
 
 
477 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  42.89 
 
 
520 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  41.78 
 
 
508 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  42.71 
 
 
513 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  41.5 
 
 
509 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  42.18 
 
 
509 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  42.39 
 
 
491 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  43.5 
 
 
507 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  41.99 
 
 
511 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  41.99 
 
 
511 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  43.27 
 
 
499 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  40.73 
 
 
502 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  41.6 
 
 
509 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  40.87 
 
 
501 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  40.28 
 
 
527 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  41.46 
 
 
519 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  42.11 
 
 
513 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  42.11 
 
 
526 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  42.11 
 
 
526 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  42.11 
 
 
526 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  42.11 
 
 
526 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  41.46 
 
 
519 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  42.51 
 
 
504 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  40.72 
 
 
501 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  42.12 
 
 
504 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  41.63 
 
 
516 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  40.08 
 
 
511 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  41.04 
 
 
512 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  42.51 
 
 
504 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  41.92 
 
 
500 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  40.84 
 
 
512 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  41.26 
 
 
519 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  43.15 
 
 
535 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  42.32 
 
 
504 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  41.92 
 
 
504 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  41.92 
 
 
504 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  41.92 
 
 
504 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  41.92 
 
 
504 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  41.92 
 
 
504 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  41.92 
 
 
504 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  41.92 
 
 
504 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  40.49 
 
 
511 aa  363  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  40.52 
 
 
510 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  40.32 
 
 
510 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  41.09 
 
 
513 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  41.09 
 
 
513 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  41.09 
 
 
513 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  41.09 
 
 
513 aa  361  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  41.09 
 
 
513 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  41.09 
 
 
513 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  41.09 
 
 
513 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  40.89 
 
 
513 aa  360  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  40.89 
 
 
513 aa  359  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  40.4 
 
 
509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  42.32 
 
 
504 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  41.92 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  41.92 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  41.92 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  43.95 
 
 
503 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  43.95 
 
 
503 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  40.96 
 
 
503 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  40.44 
 
 
501 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  40.94 
 
 
520 aa  349  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.6 
 
 
500 aa  349  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.28 
 
 
498 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  40.86 
 
 
518 aa  346  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  42.8 
 
 
493 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  42.8 
 
 
493 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  37.76 
 
 
505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  39 
 
 
494 aa  339  8e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39 
 
 
494 aa  339  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39 
 
 
494 aa  339  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39 
 
 
494 aa  339  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>