More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5271 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
325 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  97.54 
 
 
325 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  97.23 
 
 
325 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  92.31 
 
 
325 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  83.54 
 
 
325 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  81.06 
 
 
325 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  79.81 
 
 
325 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  78.77 
 
 
325 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  79.57 
 
 
328 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  78.02 
 
 
326 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  63.98 
 
 
325 aa  421  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  58.61 
 
 
334 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.32 
 
 
324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.32 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  58.39 
 
 
324 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.66 
 
 
324 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.66 
 
 
326 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.76 
 
 
324 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.76 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 
324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  57.45 
 
 
324 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.42 
 
 
326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.66 
 
 
324 aa  335  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  53.42 
 
 
324 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
326 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
326 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  55.28 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.64 
 
 
331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.62 
 
 
324 aa  325  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  54.49 
 
 
326 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  53.25 
 
 
326 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
324 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  53.25 
 
 
326 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.56 
 
 
326 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
326 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.83 
 
 
324 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.92 
 
 
324 aa  315  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  52.01 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  54.35 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
324 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.63 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  54.8 
 
 
324 aa  309  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.69 
 
 
324 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
324 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.94 
 
 
324 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
324 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
324 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 
324 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
323 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 
333 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
324 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  50.65 
 
 
324 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 
332 aa  291  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  53.25 
 
 
326 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  50.46 
 
 
325 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 
326 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.24 
 
 
328 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  45.02 
 
 
337 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 
327 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
340 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  45.96 
 
 
322 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 
323 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 
326 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  46.89 
 
 
325 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
324 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.28 
 
 
324 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
335 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.89 
 
 
324 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.18 
 
 
325 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
319 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.13 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  45.96 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.79 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
319 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
327 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
325 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 
327 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
331 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  43.41 
 
 
336 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  42.59 
 
 
331 aa  225  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  44.1 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  44.3 
 
 
329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.08 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.18 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.58 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.25 
 
 
326 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09075  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G02400)  42.26 
 
 
342 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.053291  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  41.93 
 
 
325 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>