35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5258 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5258  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5198  hypothetical protein  97.5 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5105  hypothetical protein  96.88 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0979763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5023  hypothetical protein  89.38 
 
 		 160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5432  hypothetical protein  72.19 
 
 		 161 aa  235  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68970  hypothetical protein  67.97 
 
 		 160 aa  226  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5965  hypothetical protein  67.97 
 
 		 160 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2166  hypothetical protein  56.49 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  53.38 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  58 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01871  lipoprotein, putative  52.56 
 
 		 223 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01340  hypothetical protein  46.94 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004125  hypothetical protein  46.94 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000493845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0834  hypothetical protein  46.94 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  50.35 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1689  hypothetical protein  45.27 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000692743  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1255  hypothetical protein  50.34 
 
 		 179 aa  147  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641108  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2318  hypothetical protein  45.21 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45413  predicted protein  51.01 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000791095  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2015  hypothetical protein  45.21 
 
 		 185 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0956  hypothetical protein  46.72 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1802  hypothetical protein  48.98 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  47.02 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00290  hypothetical protein  44 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2397  hypothetical protein  46.9 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2058  hypothetical protein  47.59 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3511  hypothetical protein  47.18 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1465  hypothetical protein  46.85 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0513  hypothetical protein  41.72 
 
 		 172 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00777462  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0975  hypothetical protein  43.75 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.149641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  36.48 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1551  hypothetical protein  38 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147627  hitchhiker  0.00645173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2158  translation elongation factor P (EF-P)  34.72 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401757  normal  0.635134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>