159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5227 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  100 
 
 		 266 aa  493  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  63.54 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  85.39 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  83.15 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  87.91 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  79.07 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  73.91 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  77.91 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  75 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  75 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  66.67 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  44.25 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  66.67 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  65.52 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  47.26 
 
 		 193 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  47.03 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  38.34 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  43.36 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  59.55 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  53.26 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  40.28 
 
 		 212 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  52.75 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  51.65 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  54.02 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  58.82 
 
 		 269 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  58.62 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  50.56 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  40 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  47.73 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  47.73 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  44.94 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  44.94 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  46.55 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  46.55 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  52.75 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  48.84 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.95 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  44.05 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  40 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  37.56 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  43.53 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.76 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  35.57 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  41.67 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.72 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  42.68 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  42.73 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  43.9 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  39.74 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  41.03 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  40.74 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.22 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  40.26 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  29.46 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  35.23 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  39.02 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  45.45 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  37.65 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  39.02 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  35.71 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  39.29 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  31.22 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  34.63 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  41.25 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  42.11 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  39.51 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  41.77 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  35.37 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  36.47 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  41.25 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  35.48 
 
 		 137 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  36.84 
 
 		 137 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  38.67 
 
 		 1888 aa  52.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  28.89 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  38.46 
 
 		 115 aa  52  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  40.79 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  40.79 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  35.8 
 
 		 208 aa  52.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  31.11 
 
 		 443 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  45.76 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  31.07 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.56 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  27.21 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  40.21 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.2 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.2 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  34.74 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  33.33 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  40.24 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  34.69 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  34.82 
 
 		 475 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  41.67 
 
 		 140 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  40.35 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  38.1 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  25.32 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  32.74 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  40.35 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  37.66 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  25.79 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>