More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5173 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
159 aa  323  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  98.74 
 
 
161 aa  319  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  98.74 
 
 
159 aa  319  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  98.11 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  95.6 
 
 
159 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  94.34 
 
 
159 aa  308  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  93.71 
 
 
160 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  93.71 
 
 
159 aa  307  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  91.82 
 
 
183 aa  304  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  91.82 
 
 
159 aa  304  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  85.44 
 
 
159 aa  283  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.41 
 
 
160 aa  226  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.95 
 
 
163 aa  225  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  68.42 
 
 
159 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.31 
 
 
163 aa  223  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.31 
 
 
163 aa  223  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.03 
 
 
159 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2935  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.04 
 
 
167 aa  220  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.21 
 
 
158 aa  220  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.55 
 
 
168 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4684  phosphopantetheine adenylyltransferase  69.59 
 
 
163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.45 
 
 
163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00059  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.97 
 
 
162 aa  217  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.58 
 
 
158 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.69 
 
 
160 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  67.11 
 
 
189 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.81 
 
 
168 aa  217  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  69.74 
 
 
163 aa  216  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4838  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.81 
 
 
161 aa  216  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000302126  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4471  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.92 
 
 
163 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4331  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.92 
 
 
163 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4276  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.92 
 
 
163 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0068  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.24 
 
 
163 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  67.32 
 
 
160 aa  215  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  65.61 
 
 
181 aa  215  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.29 
 
 
158 aa  215  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.9 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0548  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  65.58 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.51 
 
 
163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4095  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
159 aa  209  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.9 
 
 
159 aa  209  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.5 
 
 
160 aa  209  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.564198 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.64 
 
 
160 aa  207  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.58 
 
 
167 aa  207  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.58 
 
 
167 aa  207  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.46 
 
 
174 aa  206  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0213  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.71 
 
 
156 aa  206  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.4 
 
 
165 aa  206  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.26 
 
 
159 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.62 
 
 
159 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.62 
 
 
159 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.62 
 
 
159 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.29 
 
 
161 aa  204  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.62 
 
 
159 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.24 
 
 
159 aa  204  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
159 aa  204  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.75 
 
 
161 aa  203  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.34 
 
 
162 aa  203  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2603  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.03 
 
 
164 aa  203  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000855296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
164 aa  202  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.84 
 
 
168 aa  201  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.51 
 
 
159 aa  202  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.51 
 
 
159 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.51 
 
 
159 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  62.34 
 
 
170 aa  201  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.29 
 
 
170 aa  201  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.9 
 
 
168 aa  200  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.15 
 
 
164 aa  200  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.62 
 
 
165 aa  200  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.1 
 
 
169 aa  199  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3125  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1497  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  61.04 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0268  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.75 
 
 
162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.526112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2925  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0093  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
165 aa  198  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0298  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.09 
 
 
162 aa  198  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
165 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
165 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  60.78 
 
 
162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.97 
 
 
165 aa  197  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.21 
 
 
165 aa  196  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.21 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.21 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.21 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.21 
 
 
171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  60.53 
 
 
166 aa  194  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>