209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5155 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 
66 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  96.97 
 
 
66 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  95.45 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  95.45 
 
 
66 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  84.85 
 
 
66 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  84.85 
 
 
71 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  84.85 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  83.33 
 
 
66 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  80.3 
 
 
66 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  78.79 
 
 
66 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  77.27 
 
 
66 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  65.15 
 
 
66 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.09 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.82 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  51.52 
 
 
326 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  50 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.73 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  50 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  45.45 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.94 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  47.76 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.45 
 
 
347 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.97 
 
 
326 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.73 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.45 
 
 
374 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
211 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.97 
 
 
331 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
75 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
72 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.79 
 
 
327 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
75 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  42.65 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.87 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  36.36 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>