129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5110 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  84.31 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  84.31 
 
 		 255 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  83.01 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  71.92 
 
 		 260 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  73.79 
 
 		 260 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0330  hypothetical protein  69.69 
 
 		 258 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  61.45 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  65.28 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  39.17 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  41.55 
 
 		 382 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  43.9 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.36 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.33 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  41.1 
 
 		 395 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.93 
 
 		 238 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  41.4 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.95 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  36.82 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.11 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  36.07 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.82 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.44 
 
 		 314 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 336 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.89 
 
 		 336 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0176  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.34 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.686175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.49 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.82 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  37.5 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.44 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  38.12 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.39 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  38.12 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  38.12 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.12 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  38.12 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.83 
 
 		 251 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.12 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.12 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.05 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  37.5 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  35.65 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.49 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  36.04 
 
 		 290 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  38.29 
 
 		 482 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.11 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244614  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.05 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.05 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.89 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.48 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  37.26 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  37.26 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  37.26 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  37.26 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  37.26 
 
 		 320 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.06 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.44 
 
 		 334 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  36 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.43 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.66 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  34.98 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.81 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  34.17 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.09 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.94 
 
 		 430 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.06 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  36 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  36.21 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.82 
 
 		 476 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  32.05 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.87 
 
 		 350 aa  128  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.11 
 
 		 433 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2471  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.29 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.33 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.39 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.75 
 
 		 543 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.26 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  38.27 
 
 		 488 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00545  hypothetical protein  36.63 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.671314  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.89 
 
 		 490 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.87 
 
 		 342 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0798  divergent polysaccharide deacetylase superfamily protein  31.28 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.29 
 
 		 461 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2503  hypothetical protein  31.19 
 
 		 390 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181998  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0491  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.22 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1126  putative periplasmic protein  28.5 
 
 		 387 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0947  conserved hypothetical protein, polysaccharide deacetylase domain protein  28.83 
 
 		 355 aa  97.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2397  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.19 
 
 		 283 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1659  hypothetical protein  30.57 
 
 		 364 aa  94  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0870  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.8 
 
 		 381 aa  92  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1366  putative periplasmic protein  37.82 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.668275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>