More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5109 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  79.95 
 
 		 439 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  98.63 
 
 		 438 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  83.78 
 
 		 445 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  85.36 
 
 		 445 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  85.42 
 
 		 439 aa  730    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  96.35 
 
 		 437 aa  820    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  82.46 
 
 		 436 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 438 aa  876    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  82.32 
 
 		 438 aa  656    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  82.96 
 
 		 436 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  98.63 
 
 		 438 aa  862    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  61.06 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  56.03 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  57.29 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  59.11 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  55.56 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  56.82 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  54.15 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  56.48 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  52.52 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  55.28 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  50.85 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  52.32 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  50.57 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  50.57 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  50.11 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  53.98 
 
 		 450 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  52.09 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  55.65 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  53.32 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  50.62 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  47.42 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  52.74 
 
 		 440 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  53.44 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  55.08 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  47.14 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  55.08 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  52.93 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  54.5 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  50.24 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  50.24 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  51.14 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  49.65 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  50.12 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  48.39 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  52.79 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  52.82 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  51.36 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  52.67 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  50.79 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  49.14 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  52.94 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  49.53 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  52.03 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  50.12 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  51.11 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  48.58 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  51.11 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  49.29 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  49.52 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 		 438 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  50.12 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  47.53 
 
 		 524 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  47.53 
 
 		 524 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  49.5 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  46.7 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  47.53 
 
 		 524 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  48.41 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  47.76 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  48.72 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  47.53 
 
 		 524 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  47.95 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  47.53 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  47.53 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  47.53 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  47.48 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  51.54 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  46.26 
 
 		 515 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  49.5 
 
 		 507 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  46.26 
 
 		 515 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  46.48 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  46.26 
 
 		 515 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  47.76 
 
 		 530 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  51.41 
 
 		 434 aa  363  3e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  46.7 
 
 		 511 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  46.48 
 
 		 513 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 449 aa  362  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  47.53 
 
 		 522 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  46.88 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  48.5 
 
 		 441 aa  359  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  46.88 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  48.53 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  48.81 
 
 		 440 aa  359  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  46.19 
 
 		 440 aa  358  7e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  51.72 
 
 		 477 aa  359  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  49.74 
 
 		 446 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  47.29 
 
 		 526 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  49.63 
 
 		 445 aa  356  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>