More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5056 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  95.1 
 
 		 204 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  96.08 
 
 		 204 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  96.08 
 
 		 204 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  78.43 
 
 		 204 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  74.88 
 
 		 206 aa  323  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  77.23 
 
 		 205 aa  317  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  76.24 
 
 		 205 aa  316  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 204 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 236 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 241 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  30.43 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  32.7 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  31.87 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 223 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  32.52 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  30.48 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  34.6 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 245 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
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NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
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NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.64 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.64 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
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