194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4884 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  99.04 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  99.04 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  97.12 
 
 		 208 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  87.98 
 
 		 208 aa  347  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  83.65 
 
 		 208 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  83.65 
 
 		 208 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  83.65 
 
 		 212 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  77.88 
 
 		 208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  82.21 
 
 		 208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  77.4 
 
 		 208 aa  318  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  75 
 
 		 208 aa  311  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  79.33 
 
 		 208 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  79.33 
 
 		 208 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  79.33 
 
 		 208 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  79.33 
 
 		 208 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  78.37 
 
 		 208 aa  307  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  82.21 
 
 		 208 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  77.88 
 
 		 208 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  77.4 
 
 		 208 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  76.44 
 
 		 208 aa  292  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  81.25 
 
 		 208 aa  287  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26500  precorrin-8X methylmutase  80.77 
 
 		 208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00589849  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  76.92 
 
 		 208 aa  277  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  73.08 
 
 		 208 aa  274  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2112  precorrin-8X methylmutase  76.44 
 
 		 208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  76.44 
 
 		 208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  76.44 
 
 		 208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1162  precorrin-8X methylmutase  75.96 
 
 		 208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00824413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1603  precorrin-8X methylmutase  75.96 
 
 		 208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0265  precorrin-8X methylmutase  75.96 
 
 		 208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.187916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0895  precorrin-8X methylmutase  75.96 
 
 		 208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.182747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  71.15 
 
 		 732 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  64.25 
 
 		 209 aa  261  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  65.84 
 
 		 210 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  61.06 
 
 		 208 aa  258  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  66.35 
 
 		 209 aa  257  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  67.98 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  63.59 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0122  precorrin-8X methylmutase  65.87 
 
 		 209 aa  252  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  64.08 
 
 		 230 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  62.98 
 
 		 209 aa  250  9.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  65.35 
 
 		 210 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  62.14 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  65.35 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  58.65 
 
 		 206 aa  245  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  62.62 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  66.01 
 
 		 499 aa  242  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  63.59 
 
 		 209 aa  240  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  64.1 
 
 		 512 aa  240  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  63.11 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  59.71 
 
 		 209 aa  234  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  62.14 
 
 		 210 aa  231  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  61.65 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  60.95 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  57.07 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  63.77 
 
 		 210 aa  228  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  62.62 
 
 		 209 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  59.11 
 
 		 219 aa  227  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  60.68 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  60.87 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  62.14 
 
 		 209 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  66.67 
 
 		 209 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  63.77 
 
 		 210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  56.52 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  55.71 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0802  Precorrin-8X methylmutase  62.83 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  60.87 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  55.29 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  56.67 
 
 		 221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  61.35 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  57.14 
 
 		 211 aa  207  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3105  precorrin-8X methylmutase  54.81 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.575803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  59.38 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  57.21 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  57.21 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  57.21 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2480  Precorrin-8X methylmutase  55.9 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  55.72 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2422  precorrin-8X methylmutase  58.55 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230932  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  51.02 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  48.51 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.69 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.29 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  41.94 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.6 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  41.41 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  37.07 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.93 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  42.94 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.62 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.84 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  39.11 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>