166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4867 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  95.92 
 
 		 196 aa  343  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  95.41 
 
 		 197 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  88.78 
 
 		 196 aa  323  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  70.92 
 
 		 196 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  67.35 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  65.31 
 
 		 196 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  63.92 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  63.4 
 
 		 197 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  58.55 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  61.66 
 
 		 194 aa  217  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.11 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.21 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.27 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  40.32 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  37.8 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  37.97 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  38.65 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.04 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  36.07 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  37.8 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.64 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  34.85 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  35.64 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  36.98 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.85 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  35.83 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.82 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.84 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  38.81 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  34.33 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  47.01 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.5 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.67 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  36 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  34.01 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.33 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  32.12 
 
 		 220 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.99 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.99 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  31.94 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  33.67 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.67 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.67 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.15 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  33.67 
 
 		 217 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  32.81 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  39.53 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  38.46 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  34.46 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.48 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  30.89 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  43.93 
 
 		 111 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.22 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.5 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  33.98 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.95 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  41.9 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.36 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.03 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.77 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.03 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  30.49 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  40.37 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.45 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  34.74 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.45 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  34.74 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.53 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  29.53 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  40.95 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  40.52 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  38.39 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.19 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  41.49 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  43.82 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.19 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  36.22 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  37.17 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.47 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  37.93 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  41.3 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.63 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  28.93 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.2 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  30.2 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  37.36 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  32.43 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.65 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  40 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>