More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4843 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  98.92 
 
 
279 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  94.98 
 
 
279 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  92.47 
 
 
280 aa  527  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  92.47 
 
 
280 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  88.53 
 
 
279 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  83.75 
 
 
279 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  83.75 
 
 
279 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  79.14 
 
 
280 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  58.12 
 
 
281 aa  349  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  57.4 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  55.84 
 
 
289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2337  putative metal ion transporter  58.8 
 
 
296 aa  324  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  55.35 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3303  hypothetical protein  57.65 
 
 
292 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  52.17 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  55.47 
 
 
285 aa  301  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  54.92 
 
 
278 aa  299  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  50.89 
 
 
285 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  52.16 
 
 
283 aa  295  8e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  56.93 
 
 
279 aa  294  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  50 
 
 
291 aa  294  9e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  53.14 
 
 
282 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  51.61 
 
 
293 aa  293  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  53.79 
 
 
295 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.57 
 
 
295 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.57 
 
 
295 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.57 
 
 
295 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  51.8 
 
 
279 aa  292  5e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.57 
 
 
295 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.57 
 
 
295 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.57 
 
 
295 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  53.41 
 
 
295 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  53.41 
 
 
295 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  53.41 
 
 
295 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  53.41 
 
 
295 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  53.41 
 
 
295 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  53.41 
 
 
295 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  53.79 
 
 
311 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  53.41 
 
 
403 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.21 
 
 
295 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  50.9 
 
 
291 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  53.41 
 
 
311 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0648  CBS  52.73 
 
 
286 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.54 
 
 
291 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  51.25 
 
 
292 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.9 
 
 
292 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  51.76 
 
 
323 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  49.46 
 
 
291 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  49.46 
 
 
291 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 
291 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  49.46 
 
 
291 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  49.46 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  53.03 
 
 
298 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  50.55 
 
 
309 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  50.91 
 
 
309 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  52.04 
 
 
298 aa  285  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  51.06 
 
 
323 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  49.82 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  51.33 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  49.46 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  50.7 
 
 
293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  50.54 
 
 
292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  48.75 
 
 
286 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  51.34 
 
 
292 aa  281  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.38 
 
 
284 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  53 
 
 
292 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  52.42 
 
 
293 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  51.3 
 
 
295 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.5 
 
 
299 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2912  CBS domain-containing protein  52.48 
 
 
288 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  53.05 
 
 
291 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  50.54 
 
 
291 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  49.1 
 
 
291 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  48.75 
 
 
291 aa  267  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1833  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.73 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2918  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.73 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3008  transporter-associated region  52.73 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  52 
 
 
292 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0821  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.64 
 
 
292 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1216  transporter-associated region  53.09 
 
 
292 aa  265  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.14368  normal  0.614507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00626  predicted ion transport  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2968  transporter-associated region  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.386789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0705  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.505842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2987  transporter-associated region  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184587  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00617  hypothetical protein  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0589  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.315177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0751  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.062635  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0680  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262474  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0687  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.61 
 
 
292 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00083151  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0785  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.27 
 
 
292 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.971791  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0772  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.27 
 
 
292 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0726  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.27 
 
 
292 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0711  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.27 
 
 
292 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01227  hypothetical protein  51.13 
 
 
299 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>