More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4729 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  89.13 
 
 		 184 aa  331  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  87.03 
 
 		 185 aa  317  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  86.49 
 
 		 185 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  70.37 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  74.69 
 
 		 187 aa  247  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  74.07 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  66.67 
 
 		 186 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  67.2 
 
 		 189 aa  237  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  64.55 
 
 		 189 aa  236  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  67.46 
 
 		 187 aa  224  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  62.75 
 
 		 210 aa  185  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  57.33 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  53.7 
 
 		 211 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  57.97 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  57.34 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  54.09 
 
 		 209 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  54.09 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  51.79 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  53.79 
 
 		 210 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  55.92 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  52.2 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  54.36 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  50 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  52.74 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  51.79 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  50 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  56.2 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  51.74 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  57.34 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  48.04 
 
 		 218 aa  158  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  51.59 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  47.09 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  46.49 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  46.56 
 
 		 206 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  54.55 
 
 		 195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  45.95 
 
 		 203 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  54.19 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  54.19 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  53.25 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  51.28 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  54.19 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  45.5 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  45.5 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  45.5 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  45.5 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  52.7 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  44.97 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  44.51 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  52.5 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  51.39 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  52.94 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  52.29 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  49.03 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  45.83 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  41.76 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  44.83 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  46.25 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.1 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  46.45 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  46.45 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 		 241 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 		 250 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  46.45 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  46.45 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  46.45 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  48 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  48 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  46.15 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  51.11 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  43.53 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  44.97 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  50 
 
 		 207 aa  127  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  45.62 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  42.51 
 
 		 204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  47.62 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  47.62 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  44.65 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  50.37 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  44.68 
 
 		 181 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  47.65 
 
 		 201 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  45.27 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  45.27 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  45.27 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  48.09 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  46.04 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  41.78 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  45.75 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  46.58 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>