More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4685 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
255 aa  504  1e-142  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.08332e-07  hitchhiker  8.85497e-15 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  93.73 
 
 
255 aa  477  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.33574e-06  decreased coverage  1.13958e-08 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  93.73 
 
 
255 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  87.45 
 
 
255 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  9.29505e-13 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  72.55 
 
 
255 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.62531e-09  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  74.51 
 
 
255 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  1.46988e-14 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  69.41 
 
 
255 aa  343  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  70.98 
 
 
255 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  70.59 
 
 
255 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.51345e-05  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  46.72 
 
 
269 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  4.77386e-06 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  50.2 
 
 
253 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  46.64 
 
 
268 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  48.65 
 
 
261 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  44.84 
 
 
259 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.173e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  46.48 
 
 
270 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  46.25 
 
 
288 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  42.34 
 
 
260 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  45.85 
 
 
288 aa  200  2e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
268 aa  200  2e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  45.61 
 
 
260 aa  199  4e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 
254 aa  198  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  45.53 
 
 
266 aa  198  8e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  45.53 
 
 
266 aa  198  8e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  45.53 
 
 
266 aa  198  8e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  48.58 
 
 
261 aa  198  8e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  41.18 
 
 
260 aa  198  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.43522e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 
290 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 
288 aa  197  1e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 
272 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 
272 aa  195  5e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
259 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
272 aa  194  8e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
253 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 
274 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
536 aa  191  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
292 aa  191  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.25 
 
 
424 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  42.75 
 
 
266 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  44.14 
 
 
265 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  42.75 
 
 
256 aa  188  6e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  43.55 
 
 
260 aa  187  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  45.38 
 
 
277 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.16 
 
 
414 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 
265 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.41 
 
 
266 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.8 
 
 
266 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.21 
 
 
418 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.89 
 
 
455 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 
272 aa  182  5e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  38.28 
 
 
259 aa  181  9e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  42.63 
 
 
259 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  42.75 
 
 
293 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  38.43 
 
 
264 aa  179  5e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  44.7 
 
 
280 aa  179  5e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.55 
 
 
262 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
490 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  44.72 
 
 
264 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  42.04 
 
 
261 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  43.2 
 
 
274 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  38.28 
 
 
262 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 
273 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 
261 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  41.34 
 
 
254 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  45.45 
 
 
271 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.69 
 
 
264 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  41.53 
 
 
260 aa  175  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 
267 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  37.89 
 
 
259 aa  174  1e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  41.92 
 
 
272 aa  174  1e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.22 
 
 
262 aa  174  2e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
262 aa  173  2e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.8 
 
 
254 aa  174  2e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
266 aa  173  3e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  38.78 
 
 
259 aa  172  4e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 
273 aa  172  4e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  44.27 
 
 
266 aa  172  6e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  44.67 
 
 
284 aa  172  7e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  39.45 
 
 
418 aa  171  8e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40.38 
 
 
258 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  40.93 
 
 
274 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  38.17 
 
 
282 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  41.49 
 
 
252 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  44.3 
 
 
268 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  43.58 
 
 
274 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
265 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
264 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.39 
 
 
257 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  44.23 
 
 
276 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  43.81 
 
 
271 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.28 
 
 
285 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  37.84 
 
 
419 aa  168  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  35.91 
 
 
265 aa  168  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.21 
 
 
255 aa  168  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  41.8 
 
 
269 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  42.58 
 
 
271 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  41.94 
 
 
270 aa  168  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.13 
 
 
268 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 
276 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 
276 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  40.64 
 
 
269 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>