More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4588 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  57.27 
 
 		 881 aa  895    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  63.64 
 
 		 795 aa  1003    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  50.66 
 
 		 719 aa  666    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  94.47 
 
 		 796 aa  1533    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  55.12 
 
 		 863 aa  874    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  57.27 
 
 		 921 aa  897    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  61.34 
 
 		 679 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  50.89 
 
 		 707 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  56.67 
 
 		 778 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  49.2 
 
 		 721 aa  668    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  90.58 
 
 		 796 aa  1467    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  57.27 
 
 		 881 aa  898    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  59.9 
 
 		 810 aa  922    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  68.49 
 
 		 809 aa  1134    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  54.46 
 
 		 858 aa  857    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 796 aa  1634    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  61.49 
 
 		 742 aa  881    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  57.89 
 
 		 781 aa  772    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  53.05 
 
 		 827 aa  838    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  57.27 
 
 		 921 aa  897    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  57.27 
 
 		 881 aa  898    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  54.66 
 
 		 821 aa  831    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  94.1 
 
 		 796 aa  1526    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  54.26 
 
 		 855 aa  848    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  56.88 
 
 		 882 aa  892    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  51.71 
 
 		 708 aa  656    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  56.5 
 
 		 766 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  64.14 
 
 		 795 aa  989    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  45.98 
 
 		 724 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  54.26 
 
 		 855 aa  848    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  47.64 
 
 		 714 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  47.79 
 
 		 677 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  47.79 
 
 		 714 aa  635  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  44.37 
 
 		 713 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  45.24 
 
 		 713 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  45.01 
 
 		 713 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 709 aa  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.69 
 
 		 706 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  42.08 
 
 		 705 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 726 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 725 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  41.69 
 
 		 725 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  40.74 
 
 		 722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  40.7 
 
 		 731 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  37.84 
 
 		 793 aa  466  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  44.49 
 
 		 582 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 706 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 710 aa  317  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  33.8 
 
 		 703 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.47 
 
 		 708 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  35.08 
 
 		 689 aa  311  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 722 aa  307  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 708 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 		 722 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 701 aa  301  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  34.06 
 
 		 696 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 692 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 696 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 703 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 709 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.11 
 
 		 703 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 712 aa  287  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 711 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 710 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 792 aa  283  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 736 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 732 aa  278  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.53 
 
 		 711 aa  277  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  34.24 
 
 		 703 aa  277  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 714 aa  276  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 710 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 734 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 741 aa  273  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 701 aa  271  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 701 aa  270  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 		 701 aa  270  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.49 
 
 		 709 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 701 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 		 708 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 702 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 702 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 778 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 815 aa  260  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 862 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 701 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 		 860 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 689 aa  258  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 738 aa  257  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 701 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 701 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 726 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 799 aa  250  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 715 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 689 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 724 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 715 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>