More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4351 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  51.6 
 
 		 1573 aa  1090    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.08 
 
 		 1523 aa  651    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  93.05 
 
 		 1434 aa  2610    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.95 
 
 		 1412 aa  1444    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  64.57 
 
 		 1504 aa  1791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  69.61 
 
 		 1598 aa  801    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.67 
 
 		 1475 aa  940    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  35.73 
 
 		 1506 aa  639    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  92.9 
 
 		 1426 aa  2598    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  69.61 
 
 		 1700 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.41 
 
 		 1518 aa  1741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  70.88 
 
 		 1431 aa  1984    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  59.31 
 
 		 1515 aa  965    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  34.91 
 
 		 1523 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.68 
 
 		 1626 aa  900    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  69.61 
 
 		 1599 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  36.23 
 
 		 1480 aa  675    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  64.18 
 
 		 1510 aa  1790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1429 aa  2860    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  34.81 
 
 		 1531 aa  668    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  47.57 
 
 		 1435 aa  1228    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  35.21 
 
 		 1523 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  69.78 
 
 		 1598 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.97 
 
 		 1497 aa  1833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.55 
 
 		 1505 aa  1741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.39 
 
 		 1508 aa  961    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  66.95 
 
 		 1448 aa  1834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  49.9 
 
 		 1419 aa  1165    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 1539 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  50.28 
 
 		 1388 aa  1201    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  69.61 
 
 		 1598 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.37 
 
 		 1516 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 		 1523 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.24 
 
 		 1514 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  86.31 
 
 		 1451 aa  2458    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  66.81 
 
 		 1448 aa  1833    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  69.61 
 
 		 1598 aa  801    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.03 
 
 		 1480 aa  1723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  69.61 
 
 		 1598 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  35.41 
 
 		 1544 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.24 
 
 		 1517 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  35.06 
 
 		 1536 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.53 
 
 		 1553 aa  632  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  35.34 
 
 		 1536 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  33.53 
 
 		 1567 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  35.4 
 
 		 1536 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  35.13 
 
 		 1509 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  34.82 
 
 		 1535 aa  625  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.97 
 
 		 1561 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  34.46 
 
 		 1493 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  34.67 
 
 		 1632 aa  621  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.68 
 
 		 1476 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.57 
 
 		 1613 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  34.09 
 
 		 1572 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  34.84 
 
 		 1549 aa  606  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  35.36 
 
 		 1513 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  33.88 
 
 		 1584 aa  599  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  34.15 
 
 		 1694 aa  592  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  32.85 
 
 		 1534 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  34.26 
 
 		 1606 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.88 
 
 		 1538 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.78 
 
 		 1538 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  31.68 
 
 		 1538 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  31.61 
 
 		 1538 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1538 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  33.21 
 
 		 1601 aa  557  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.7 
 
 		 1525 aa  558  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.68 
 
 		 1538 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.61 
 
 		 1538 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  36.46 
 
 		 1688 aa  528  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00432  ATP-dependent DNA helicase  67.41 
 
 		 398 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.25 
 
 		 1534 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.37 
 
 		 1381 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  31.23 
 
 		 1379 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  35.01 
 
 		 1618 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.17 
 
 		 1502 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  34.95 
 
 		 1495 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.79 
 
 		 1694 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  33.96 
 
 		 1729 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  33.87 
 
 		 1741 aa  456  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.19 
 
 		 875 aa  450  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  34.66 
 
 		 888 aa  453  1e-125  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  32.55 
 
 		 873 aa  446  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  34.11 
 
 		 870 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  31.63 
 
 		 872 aa  425  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  32.6 
 
 		 874 aa  423  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  32.61 
 
 		 874 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  32.29 
 
 		 874 aa  423  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  41.55 
 
 		 1620 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  33.33 
 
 		 872 aa  420  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  31.17 
 
 		 1649 aa  413  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  33.97 
 
 		 922 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  33.93 
 
 		 1644 aa  406  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  31.87 
 
 		 1604 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  33.6 
 
 		 914 aa  401  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  33.45 
 
 		 915 aa  403  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  33.37 
 
 		 941 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.06 
 
 		 900 aa  353  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  30.31 
 
 		 1523 aa  346  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 927 aa  327  1e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>