More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4325 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  630  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  89.39 
 
 		 313 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  88.75 
 
 		 317 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  86.93 
 
 		 324 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  69.06 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  68.42 
 
 		 302 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  71.03 
 
 		 301 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  63.29 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  63.6 
 
 		 321 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  64 
 
 		 321 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  36.86 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  30.85 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  29.39 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  29.86 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  28.28 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  29.51 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  28.98 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  25.94 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  26.99 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  26.99 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  26.99 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  26.99 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  27.41 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.16 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  28.06 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  26.3 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.87 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  28.18 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  26.09 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  27.11 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  28.19 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  25.86 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  26.5 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.59 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  26.59 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.93 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  26.22 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.24 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37.07 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  36.21 
 
 		 670 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 638 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  35.16 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  41.18 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.73 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.54 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  39 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  39 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.96 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  39 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  38 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.63 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  39 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  39 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  39 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  39 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  43.06 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 658 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 499 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.33 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  36.84 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  31.9 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 		 630 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.71 
 
 		 542 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  47.89 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  41.33 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.75 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  41.67 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  41.33 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  34.23 
 
 		 1313 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  36.27 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.11 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  33.33 
 
 		 641 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>