More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4203 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  99.43 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  99.43 
 
 		 174 aa  347  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  98.85 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  89.66 
 
 		 174 aa  316  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  89.2 
 
 		 176 aa  314  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  86.21 
 
 		 174 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  85.14 
 
 		 175 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  83.75 
 
 		 174 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  82.5 
 
 		 174 aa  276  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  84.38 
 
 		 174 aa  253  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.54 
 
 		 173 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  61.18 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.59 
 
 		 173 aa  204  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  58.96 
 
 		 173 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 173 aa  198  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  58.82 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  64.56 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  60.12 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  62.35 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  60.69 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  60.69 
 
 		 173 aa  187  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  60.69 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  61.76 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  61.76 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  61.76 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  61.76 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  61.18 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  61.18 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  61.18 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.96 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  60.59 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  61.85 
 
 		 173 aa  180  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  57.23 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  60.8 
 
 		 173 aa  175  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  58.29 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  57.47 
 
 		 173 aa  174  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  59.66 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  50.27 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  56.07 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  50.27 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  55.49 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  56.07 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  56.07 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  56.07 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  56.07 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  61.18 
 
 		 173 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  54.91 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  54.91 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  54.91 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  57.24 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  58.17 
 
 		 189 aa  167  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  55.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  55.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  55.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  55.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  55.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  55.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  55.49 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  57.24 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  54.91 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.66 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  47.31 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  52.63 
 
 		 176 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  55.63 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.87 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 		 164 aa  160  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 		 180 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 		 180 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.06 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  51.9 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  55.75 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  51.9 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  51.68 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  49.42 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  52.32 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 275 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 284 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  49.14 
 
 		 180 aa  150  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01729  Holliday junction resolvase  62.18 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000012224  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  50.32 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  49.68 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.04 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>