28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4090 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  783    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  59.27 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  43.22 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  40.96 
 
 		 403 aa  262  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  41.18 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  38.83 
 
 		 393 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  38.83 
 
 		 393 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  40.15 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  35.31 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  35.71 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  35.93 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  35.56 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  35.28 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  33.58 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  30.97 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  31.09 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  30.15 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  29.25 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  40.49 
 
 		 208 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  30.35 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  24.01 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  25.58 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  30.18 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  26.29 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  25.67 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  25.67 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  28.22 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.69 
 
 		 1868 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>