More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4081 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  79.03 
 
 		 292 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  79.27 
 
 		 246 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  74.81 
 
 		 284 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  74.62 
 
 		 283 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  72.9 
 
 		 301 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  67.51 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  65.67 
 
 		 282 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  67.44 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  64.94 
 
 		 303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  38.38 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  39.6 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  36.57 
 
 		 628 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  35.22 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  36.86 
 
 		 556 aa  168  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  37.5 
 
 		 654 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  37.74 
 
 		 413 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  36.27 
 
 		 549 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  36.27 
 
 		 600 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  38.85 
 
 		 1911 aa  165  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  37.11 
 
 		 657 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  41.7 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  38.46 
 
 		 616 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  40.61 
 
 		 535 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  41.47 
 
 		 892 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  40.61 
 
 		 570 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 		 882 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  37.75 
 
 		 929 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  40 
 
 		 820 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  39.47 
 
 		 523 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  39.11 
 
 		 416 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  39.13 
 
 		 636 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  36.8 
 
 		 740 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  35.14 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  36.4 
 
 		 603 aa  148  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  39.13 
 
 		 522 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  37.2 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  36.8 
 
 		 497 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  39.26 
 
 		 877 aa  145  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 		 698 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 		 623 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  37.25 
 
 		 491 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  35.74 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  35.43 
 
 		 781 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  34.68 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  36.53 
 
 		 538 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 		 925 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  38.4 
 
 		 664 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 620 aa  138  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  34.66 
 
 		 802 aa  138  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  36.69 
 
 		 587 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1196 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 		 618 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  36.02 
 
 		 527 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  35.18 
 
 		 637 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 		 637 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  35.21 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  35.6 
 
 		 621 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  33.59 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  31.94 
 
 		 551 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  32.2 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  34.83 
 
 		 654 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  36.17 
 
 		 625 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 		 617 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 		 593 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  34.4 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  37.89 
 
 		 862 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  34.77 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 611 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  32.56 
 
 		 348 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  34.23 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  36.25 
 
 		 620 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.58 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  33.45 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  33.47 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  33.72 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.23 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  32.23 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  31.73 
 
 		 1104 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 		 616 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  33.86 
 
 		 611 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 639 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 639 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.16 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.09 
 
 		 1132 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  31.76 
 
 		 426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.55 
 
 		 751 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.82 
 
 		 398 aa  115  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  33.94 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  32.31 
 
 		 584 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.8 
 
 		 554 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  34 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  32.62 
 
 		 359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 		 668 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.99 
 
 		 826 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  31.89 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  34.75 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.45 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  32.54 
 
 		 398 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>