More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4005 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  98.19 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  97.74 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  94.57 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  78.95 
 
 		 209 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  74.88 
 
 		 222 aa  345  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  74.31 
 
 		 222 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  76.1 
 
 		 209 aa  323  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  71.29 
 
 		 209 aa  322  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  70.81 
 
 		 209 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  67.32 
 
 		 209 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  65.37 
 
 		 207 aa  295  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  64.73 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60.77 
 
 		 210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  60.49 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  58.85 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  63.41 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  61.95 
 
 		 206 aa  268  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  61.46 
 
 		 206 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  61.46 
 
 		 206 aa  266  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  60.49 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  57.8 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  57.8 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  60.7 
 
 		 207 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.61 
 
 		 207 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60.68 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  59.33 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  60.68 
 
 		 206 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  60.19 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.81 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  59.81 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.81 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.71 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  57.42 
 
 		 215 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.62 
 
 		 207 aa  258  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60.49 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60.68 
 
 		 206 aa  258  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  58.54 
 
 		 207 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  60.49 
 
 		 206 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  58.05 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  60.49 
 
 		 206 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  60.19 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.85 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.5 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  59.02 
 
 		 206 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.85 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.89 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2184  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.89 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2702  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.89 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3133  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.89 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.56 
 
 		 207 aa  254  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.89 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.89 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2569  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.89 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.54 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.52 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.54 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  56.59 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1141  hypothetical protein  58.13 
 
 		 207 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  58.74 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  58.74 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.8 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.34 
 
 		 206 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  55.07 
 
 		 207 aa  248  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  57.07 
 
 		 209 aa  248  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.61 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.66 
 
 		 206 aa  247  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2552  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.1 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000159631  normal  0.146641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1581  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family translation factor  55.61 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132885  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.71 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.74 
 
 		 206 aa  244  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  56.72 
 
 		 206 aa  241  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.73 
 
 		 206 aa  241  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.63 
 
 		 206 aa  241  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.68 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.24 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2401  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.83 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.907805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1728  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.06 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.856761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.34 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1688  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.83 
 
 		 206 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2720  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.34 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1666  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.34 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00411691  hitchhiker  0.000419541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2699  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.34 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2799  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.34 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.703819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1522  translation factor SUA5  54.37 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0107346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1464  translation factor SUA5  54.37 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1530  translation factor SUA5  54.37 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.473863  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1038  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.3 
 
 		 204 aa  228  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>