More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3976 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  99.58 
 
 		 480 aa  952    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  89.17 
 
 		 480 aa  867    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  89.38 
 
 		 480 aa  870    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  96.25 
 
 		 480 aa  924    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  91.88 
 
 		 480 aa  892    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  86.31 
 
 		 482 aa  847    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  100 
 
 		 480 aa  955    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  68.13 
 
 		 479 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  99.58 
 
 		 480 aa  952    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  68.61 
 
 		 480 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  89.17 
 
 		 480 aa  868    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  85 
 
 		 480 aa  796    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  86.31 
 
 		 482 aa  847    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  66.67 
 
 		 494 aa  608  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  59.17 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  62.79 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  55.42 
 
 		 481 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  55.02 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  55.02 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  55.02 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  55.04 
 
 		 477 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  54.44 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  54.2 
 
 		 492 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  54.68 
 
 		 492 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  46.67 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  47.17 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  43.61 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  43.52 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  41.63 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  46.6 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  44.1 
 
 		 450 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  42.67 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  41.43 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  40.22 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  42.69 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  40.74 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  42.02 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  40.49 
 
 		 454 aa  332  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  41.72 
 
 		 455 aa  332  9e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  42.69 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  38.23 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  41.27 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  40.81 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  41.27 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  40.68 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  40.42 
 
 		 454 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  40.05 
 
 		 452 aa  326  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  41.12 
 
 		 454 aa  326  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  40.05 
 
 		 454 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  39.25 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  39.25 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  38.68 
 
 		 454 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  39.25 
 
 		 454 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  39.72 
 
 		 454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  37.93 
 
 		 451 aa  303  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  41.47 
 
 		 452 aa  302  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  39.53 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  37.67 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  39.51 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.67 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  37.42 
 
 		 492 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  39.25 
 
 		 445 aa  290  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  38.02 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  37.97 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  35.63 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  35.56 
 
 		 445 aa  280  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  35.63 
 
 		 456 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.52 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  37.65 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  35.39 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  35.32 
 
 		 445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  34.76 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  38.05 
 
 		 471 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  37.82 
 
 		 471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  37.41 
 
 		 476 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  35.7 
 
 		 473 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  36.69 
 
 		 471 aa  269  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.1 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  35.63 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  35.63 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  35.63 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  35.63 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  38.6 
 
 		 462 aa  266  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  34.6 
 
 		 455 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  36.12 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  37.81 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  36.43 
 
 		 481 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  34.52 
 
 		 458 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  33.49 
 
 		 448 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  34.76 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  35.39 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  38.12 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  35.86 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  36.92 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  35.16 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  35.16 
 
 		 459 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  35.24 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  33.79 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  35.18 
 
 		 482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>