231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3971 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  41.07 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  41.7 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  40.76 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  41.48 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  42.08 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  39.27 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  39.9 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  36.32 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  38.46 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  37.44 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  36.89 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  39.29 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  36.28 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  35.87 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  36.12 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  34.82 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  35.71 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  37.95 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  33.91 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  33.77 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  33.77 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  41.04 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  34.19 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  33.33 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  32.89 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  35.91 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  32.44 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  33.64 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  31.58 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  31.15 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  34.83 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.31 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  31.78 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  31.12 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  31.12 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  34.33 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  34.33 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  33.33 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  34.33 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  29.52 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  33.17 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  35.41 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  29.41 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  28.05 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  28.63 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  32.6 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  31.02 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  28.46 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  28.63 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  33.33 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  31.02 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  31.02 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  33.33 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  30.73 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  33.33 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  33.33 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  27.53 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  32.24 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  33.06 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  30.87 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  31.7 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  31.72 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  30.87 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  32.77 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  32.77 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  30.39 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  31.95 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  32.35 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  26.64 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  31.78 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  33.33 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.58 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  31.95 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  34.29 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  34.29 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  33.19 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  30.43 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  25.73 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  32.26 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  28.26 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  34.67 
 
 		 282 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  27.72 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  31.03 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  30.21 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  30.21 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  30.51 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  33.89 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  33.89 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.04 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  30.94 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.14 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  28.83 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.71 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.71 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  29.73 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  29.78 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.71 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  34.78 
 
 		 252 aa  88.6  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.71 
 
 		 241 aa  88.2  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>