216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3944 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  99.19 
 
 		 369 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  91.06 
 
 		 369 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  91.06 
 
 		 369 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  94.6 
 
 		 362 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  97.02 
 
 		 369 aa  711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 371 aa  735    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  90.49 
 
 		 369 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  90.49 
 
 		 369 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  99.19 
 
 		 369 aa  724    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  86.58 
 
 		 386 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  68.22 
 
 		 380 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  67.86 
 
 		 379 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  64.99 
 
 		 367 aa  471  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  67.72 
 
 		 401 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  63.96 
 
 		 365 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  65.01 
 
 		 362 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  62.81 
 
 		 376 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  62.71 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  62.93 
 
 		 372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  61.26 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  63.26 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  61.08 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  63.26 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  61.81 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  61.54 
 
 		 363 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  61.48 
 
 		 363 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  60.38 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  60.05 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  60.06 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  60.38 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  61.71 
 
 		 368 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  60.71 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  60.38 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  60.38 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  60.27 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  58.62 
 
 		 370 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  59.62 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  60.74 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  60.27 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  60.22 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  60.34 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  60 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  59.07 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  57.18 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  56.3 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  56.5 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  57.26 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  54.4 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  54.5 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  54.28 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  54.28 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  54.28 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  53.07 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  53.02 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  53.14 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  53.51 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  51.61 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  55.15 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  57.34 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  54.62 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  54.87 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  54.34 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  54.29 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  54.62 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  54.62 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  54.06 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  54.62 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  54.62 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  54.28 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  54.34 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  53.44 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  51.88 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  54.34 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  54.52 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  50.8 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  55.43 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  50.8 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  54 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  53.54 
 
 		 370 aa  361  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  55.28 
 
 		 398 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  52.5 
 
 		 372 aa  359  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  52.37 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  54.27 
 
 		 365 aa  356  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  53.19 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  56.06 
 
 		 371 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  50.72 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  52.42 
 
 		 388 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  50.39 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  52.7 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3787  flagellar basal body P-ring protein  55.46 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  53.82 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004166  flagellar P-ring protein FlgI  63.18 
 
 		 278 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  51 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  52.87 
 
 		 368 aa  345  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  49.46 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  53.54 
 
 		 376 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  49.17 
 
 		 371 aa  344  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  48.79 
 
 		 374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  48.95 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>