More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3939 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 483 aa  927    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  52.72 
 
 		 488 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  46.67 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  46.46 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  44.87 
 
 		 485 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  44.47 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  45.84 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  45.21 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  45.64 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  44.44 
 
 		 516 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  43.88 
 
 		 517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  40.78 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  43.92 
 
 		 493 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  39.18 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  42.27 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  39.69 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  40.67 
 
 		 475 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  37.04 
 
 		 497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  41.51 
 
 		 501 aa  273  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  41.57 
 
 		 492 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  39.61 
 
 		 506 aa  269  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  37.8 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  40.2 
 
 		 492 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  36.11 
 
 		 493 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  36.06 
 
 		 493 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  37.75 
 
 		 462 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  60.63 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  59.73 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  35.92 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  37.3 
 
 		 486 aa  230  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  33.79 
 
 		 492 aa  224  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.86 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  35.24 
 
 		 506 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  35.24 
 
 		 506 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  65.09 
 
 		 687 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  35.08 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  61.93 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  36.7 
 
 		 493 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  34.46 
 
 		 502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  45.19 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  47.35 
 
 		 377 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  46.46 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  45.53 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  41.04 
 
 		 375 aa  194  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  41.42 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  45.05 
 
 		 377 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  32.53 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  49.78 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  48.68 
 
 		 377 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  48.46 
 
 		 376 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  41.05 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  47.37 
 
 		 377 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  47.37 
 
 		 377 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  44.9 
 
 		 377 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  40.99 
 
 		 384 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  48.25 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  42.9 
 
 		 609 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  44.9 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  43.27 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  59.01 
 
 		 376 aa  187  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  56.48 
 
 		 282 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  45.71 
 
 		 378 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  48.02 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 		 294 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  30.05 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  41.84 
 
 		 385 aa  181  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  61.84 
 
 		 283 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  52.58 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  55.95 
 
 		 294 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  31.4 
 
 		 502 aa  176  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  54.66 
 
 		 580 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  56.6 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  32.56 
 
 		 481 aa  170  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0568  flagellin B  29.98 
 
 		 496 aa  169  9e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  56.44 
 
 		 282 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.88 
 
 		 280 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  52.06 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  52.94 
 
 		 272 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  52.94 
 
 		 272 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  52.94 
 
 		 404 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  54.66 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  54.66 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  53.29 
 
 		 587 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  54.14 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2297  flagellin B  29.89 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  53.42 
 
 		 271 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  53.42 
 
 		 271 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  58.55 
 
 		 283 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  56.69 
 
 		 471 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  51.63 
 
 		 273 aa  162  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  40.5 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  51.76 
 
 		 271 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  51.76 
 
 		 271 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  39.67 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  50.82 
 
 		 270 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  54.66 
 
 		 472 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  48.24 
 
 		 274 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  51.85 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  51.37 
 
 		 272 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  50.27 
 
 		 273 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>