More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3845 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  100 
 
 
434 aa  897    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  98.39 
 
 
434 aa  885    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  77.26 
 
 
437 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  75.81 
 
 
433 aa  698    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  77.67 
 
 
444 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  82.95 
 
 
434 aa  770    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  95.16 
 
 
434 aa  864    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  78.57 
 
 
434 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  99.08 
 
 
434 aa  891    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  78.8 
 
 
434 aa  710    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  72.96 
 
 
432 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  68.76 
 
 
433 aa  621  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  63.93 
 
 
449 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  62.53 
 
 
466 aa  554  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  59.07 
 
 
441 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  57.97 
 
 
456 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  55.99 
 
 
439 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  56.25 
 
 
432 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  55.99 
 
 
439 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  55.99 
 
 
438 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  55.76 
 
 
438 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  55.53 
 
 
438 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  55.76 
 
 
438 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  55.76 
 
 
438 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  59.91 
 
 
446 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  55.53 
 
 
438 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  57.92 
 
 
435 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  58.1 
 
 
443 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  58.28 
 
 
429 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  56.83 
 
 
452 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  56.1 
 
 
457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  54.4 
 
 
449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  56.59 
 
 
452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  52.78 
 
 
439 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  52.78 
 
 
438 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  56.87 
 
 
486 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  52.31 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  52.67 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  52.67 
 
 
439 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  52.67 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  53.01 
 
 
457 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  52.11 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  50.35 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  51.86 
 
 
451 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  50.58 
 
 
431 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  52.31 
 
 
438 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  49.18 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  49.18 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  51.75 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  51.52 
 
 
457 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  53.81 
 
 
437 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  52.08 
 
 
441 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  51.04 
 
 
461 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  53.49 
 
 
454 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  53.01 
 
 
436 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  49.29 
 
 
428 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  53.01 
 
 
436 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  53.01 
 
 
436 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  49.41 
 
 
440 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  53.01 
 
 
436 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  53.01 
 
 
436 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  53.01 
 
 
436 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  53.01 
 
 
436 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  50.82 
 
 
444 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  50 
 
 
445 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  50.59 
 
 
444 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  48.03 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  51.35 
 
 
435 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  49.41 
 
 
446 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  49.3 
 
 
435 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  48.92 
 
 
435 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  48.79 
 
 
436 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  50 
 
 
453 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  48.92 
 
 
428 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  48.92 
 
 
433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  47.85 
 
 
426 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  49.26 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  47.95 
 
 
425 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  48.97 
 
 
513 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  46.54 
 
 
429 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  48.03 
 
 
427 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  48.03 
 
 
427 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  47.1 
 
 
430 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  48.61 
 
 
428 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  46.67 
 
 
434 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  46.85 
 
 
445 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  46.05 
 
 
428 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  45.85 
 
 
449 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  46.71 
 
 
432 aa  360  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  45.25 
 
 
445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  43.08 
 
 
454 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  40.13 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  43.53 
 
 
430 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  42.33 
 
 
444 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  40.93 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  39.67 
 
 
432 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  36.54 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  39.77 
 
 
439 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  38.43 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4377  guanine deaminase  36.82 
 
 
469 aa  246  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>