More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3843 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  78.17 
 
 		 797 aa  1274    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.86 
 
 		 767 aa  695    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.16 
 
 		 788 aa  827    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.62 
 
 		 784 aa  803    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  52.12 
 
 		 781 aa  784    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  98.37 
 
 		 799 aa  1643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  54.13 
 
 		 792 aa  795    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  61.99 
 
 		 796 aa  980    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  54.7 
 
 		 780 aa  788    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  85.48 
 
 		 792 aa  1415    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.73 
 
 		 787 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  84.82 
 
 		 839 aa  1419    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.26 
 
 		 793 aa  780    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.13 
 
 		 785 aa  814    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  53.46 
 
 		 793 aa  817    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.87 
 
 		 787 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  87.72 
 
 		 797 aa  1463    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.93 
 
 		 787 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.73 
 
 		 787 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  54.27 
 
 		 784 aa  812    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.42 
 
 		 764 aa  762    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  100 
 
 		 799 aa  1666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  56.27 
 
 		 787 aa  766    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  72.09 
 
 		 797 aa  1201    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.33 
 
 		 784 aa  801    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.3 
 
 		 800 aa  804    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  84.93 
 
 		 799 aa  1385    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  44.47 
 
 		 804 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.13 
 
 		 801 aa  754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  58.36 
 
 		 794 aa  900    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  98.12 
 
 		 799 aa  1637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.89 
 
 		 779 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  50.13 
 
 		 801 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  53.66 
 
 		 802 aa  808    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.49 
 
 		 788 aa  802    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.96 
 
 		 779 aa  853    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  57.11 
 
 		 797 aa  868    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  50.57 
 
 		 812 aa  737    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  56.69 
 
 		 856 aa  876    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.71 
 
 		 814 aa  702    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  53.2 
 
 		 783 aa  781    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  45.14 
 
 		 800 aa  658    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  96.5 
 
 		 799 aa  1584    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  49.68 
 
 		 782 aa  735    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  54.02 
 
 		 777 aa  813    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  55.2 
 
 		 787 aa  812    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.29 
 
 		 785 aa  807    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.2 
 
 		 787 aa  811    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.37 
 
 		 788 aa  797    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  56.31 
 
 		 784 aa  857    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.58 
 
 		 808 aa  761    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  55.15 
 
 		 777 aa  810    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  55.06 
 
 		 781 aa  834    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  54.93 
 
 		 787 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  84.93 
 
 		 799 aa  1386    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  55.33 
 
 		 787 aa  814    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.76 
 
 		 816 aa  753    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.29 
 
 		 788 aa  825    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.99 
 
 		 787 aa  773    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.87 
 
 		 787 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  53.1 
 
 		 770 aa  771    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.87 
 
 		 787 aa  750    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.05 
 
 		 788 aa  810    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.02 
 
 		 818 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  45.63 
 
 		 772 aa  662    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.22 
 
 		 781 aa  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.05 
 
 		 779 aa  818    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  84.14 
 
 		 798 aa  1384    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  52.98 
 
 		 823 aa  744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  51.47 
 
 		 799 aa  754    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.1 
 
 		 779 aa  772    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  50.99 
 
 		 801 aa  752    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.73 
 
 		 787 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  50.13 
 
 		 828 aa  739    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  51.36 
 
 		 830 aa  744    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.73 
 
 		 787 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  44.46 
 
 		 767 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  40.6 
 
 		 1363 aa  545  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  37.89 
 
 		 769 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  39.56 
 
 		 1350 aa  522  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  37.93 
 
 		 1387 aa  468  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  57.82 
 
 		 825 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  57.56 
 
 		 825 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  57.03 
 
 		 825 aa  436  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  55.87 
 
 		 812 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.99 
 
 		 754 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  30.28 
 
 		 730 aa  301  4e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4003  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.95 
 
 		 772 aa  264  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.567509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5971  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  29.22 
 
 		 715 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2835  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, alpha subunit  30.03 
 
 		 797 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1446  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.29 
 
 		 714 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2136  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.22 
 
 		 768 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1135  hypothetical protein  26.69 
 
 		 713 aa  249  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3076  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.74 
 
 		 757 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346881  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  26.9 
 
 		 753 aa  245  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3594  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.37 
 
 		 774 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.5 
 
 		 782 aa  243  9e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2066  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.58 
 
 		 1062 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0951038  normal  0.0311361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1817  hypothetical protein  27.74 
 
 		 766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1504  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  27.14 
 
 		 758 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>