More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3758 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.16 
 
 
478 aa  956    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.15 
 
 
479 aa  659    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.74 
 
 
478 aa  954    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  87.87 
 
 
478 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.82 
 
 
478 aa  854    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.1 
 
 
478 aa  823    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.77 
 
 
478 aa  916    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.55 
 
 
477 aa  791    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.95 
 
 
478 aa  956    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.52 
 
 
478 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.06 
 
 
479 aa  638    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.56 
 
 
480 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
478 aa  962    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.52 
 
 
478 aa  821    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.63 
 
 
484 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0104  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.74 
 
 
483 aa  560  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.25 
 
 
483 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0268  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.21 
 
 
485 aa  557  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.84 
 
 
474 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.79 
 
 
478 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.06 
 
 
473 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2632  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.16 
 
 
478 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.586503 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.32 
 
 
476 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01196  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.58 
 
 
478 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738792  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.54 
 
 
476 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.32 
 
 
476 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.16 
 
 
478 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 
476 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 
476 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 
476 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.18 
 
 
476 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 
476 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 
476 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.35 
 
 
476 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.26 
 
 
476 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.26 
 
 
476 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.14 
 
 
476 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.26 
 
 
476 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.26 
 
 
476 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.07 
 
 
480 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.63 
 
 
476 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.63 
 
 
476 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.63 
 
 
476 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.02 
 
 
474 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.22 
 
 
474 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.97 
 
 
478 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.6 
 
 
478 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.81 
 
 
478 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 
474 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0855  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.58 
 
 
483 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.301794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.67 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.82 
 
 
478 aa  491  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.82 
 
 
496 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.93 
 
 
475 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.7 
 
 
468 aa  487  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.28 
 
 
598 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.81 
 
 
475 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.81 
 
 
475 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.45 
 
 
475 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.31 
 
 
481 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.01 
 
 
478 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3246  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.45 
 
 
475 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0895727  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 
478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3495  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.03 
 
 
484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11068  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.09 
 
 
475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.77 
 
 
469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.5 
 
 
475 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.45 
 
 
489 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.21 
 
 
476 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
468 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.1 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2881  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.45 
 
 
475 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.34 
 
 
581 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.65 
 
 
467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  50.32 
 
 
466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 
468 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 
467 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  49.89 
 
 
500 aa  449  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.48 
 
 
467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.05 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.94 
 
 
468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 
466 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
462 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.49 
 
 
467 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 
467 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.06 
 
 
467 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
467 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.06 
 
 
467 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.94 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.73 
 
 
468 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 
467 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.94 
 
 
468 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.94 
 
 
468 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.15 
 
 
467 aa  438  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
467 aa  438  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 
467 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
467 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 
467 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 
470 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>